程序员经验分享-hwhale

使用Cytoscape画PPI网络图

2023-10-26

打开Cytoscape软件，根据菜单导入string_interactions.tsv文件

File ----> Import ----> Network from File

会弹出下图对话框，在对话框中设置如下：

选中string_interactions.tsv文件，点击打开，导入文件，结果如下图所示。

点击OK，弹出如下视图，ctrl+A选中所有基因节点

使用NetworkAnalyzer分析调整网络图

Tools ---> NetworkAnalyzer ---> Network Analysis ---> Analyze Network

弹出如下跳选框

选择Treat the network as undirected，点击ok

最终生成下图网络

 

转载于:https://www.cnblogs.com/yahengwang/p/10652348.html

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python

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