在 R markdown 中嵌入绘图输出

有一个博客条目它描述了从 R 的plotly API 嵌入到 R markdown 中。我只是使用代码为 html 文档创建 iframe

当我在 R studio 中预览时，没有错误消息，并且 iframe 是在 html 文档中创建的。然而，它只是空的。显然它不会以某种方式加载内容。我没有事先在 R API 中创建绘图（但这应该不重要，因为这只是将图片嵌入到 html 中）不是吗？

我目前在 r markdown 中的代码是

```{r}
library("knitr")
library("devtools")
url<-"https://plot.ly/~etpinard/251"
plotly_iframe <- paste("<iframe scrolling='no' seamless='seamless' src='", url, 
    "/800/600' width='800' height='600'></iframe>", sep = "")

```
`r I(plotly_iframe)`

我们第一次发布 RPub 时也遇到了同样的问题。Here是您在已发布的 RPub 中的代码。

一旦在 RPubs.com 上发布而不是预览，这些图表should出现。您可以使用 RPubs 中的“在浏览器中打开”选项来测试它：

一张纸条。我变了height到 800 和width到 650，因为该图有点高。我还添加了一个<center>标签将其放置在已发布版本的中心。

Plotly 还有一个用于嵌入的目标 URL。在这种情况下，它是https://plot.ly/~etpinard/251.embed。不过 RPubs 似乎并不喜欢这样。你也可以玩玩borderwidth看看是否可以关闭边框。

这就是说：图表不会显示在预览中。我相信这是浏览器的限制，因为 RStudio 还不允许发布实时 Web 内容。

如果您有兴趣并且想要一些示例代码，这是来源 for 一篇博文嵌入了 Plotly 和 ggplot2 绘图。希望这可以帮助！披露：我为 Plotly 工作。

更新：2015 年 8 月 21 日

前往 Plotly 文档查看R Markdown这个答案的版本。在 R 控制台中打印绘图对象会创建一个在线图形。例如：

p <- plot_ly(economics, x = date, y = uempmed, filename="r-docs/knitr-example")

如果您使用 knit/R Markdown 和 HTML 输出，则打印plotly对象现在会将绘图作为 iframe 嵌入 HTML 中。如果您正在使用 R Markdown 编写文档，只需打印p将嵌入情节。

您还可以使用宽度和高度代码块参数设置绘图的宽度和高度。例如：{r, height=800} 设置高度。

如果您正在使用使用 R Studio 离线绘制，然后在knitr中打印plotly对象还将包括绘制图形所需的plotly.js文件：图形在文档内本地渲染。

要将knitr文档转换为独立的HTML文件，请使用knitr::knit and markdown::markdownToHTML。例如：

knitr::knit('plotly-report.Rmd', 'plotly-report.md')
markdown::markdownToHTML('plotly-report.md', 'plotly-report.html')