程序员经验分享-hwhale

libstdc++.so.6：在 Linux 上找不到版本“GLIBCXX_3.4.26”

2023-11-22

我试图在 rstudio 中加载 Seurat 包并收到此错误

Error: package or namespace load failed for ‘Seurat’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/envs/test2/lib/R/library/Rcpp/libs/Rcpp.so':
  /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.26' not found (required by /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/envs/test2/lib/R/library/Rcpp/libs/Rcpp.so)

我在 conda 环境中使用 rstudio

我发现了一个关于没有版本“GLIBCXX_3.4.26”的相同问题的问题。这导致我运行这个命令

strings /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX

我得到了这个：

GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_3.4.20
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.22
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.24
GLIBCXX_3.4.25
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH

因此，它没有所需的版本，我无法从终端安装 libstdc++，因为该步骤需要 sudo 命令，而我不是 sudo 者之一，而且我一直被拒绝许可。

乌班图18.04.6

Linux 4.15.0-154-通用

那么除了sudo命令之外还有什么办法可以解决这个问题呢？

我在 conda 环境中尝试了这个命令

strings msmuhammad/workbench/miniconda3/envs/test2/lib/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX

我得到了这个

GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_3.4.20
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.22
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.24
GLIBCXX_3.4.25
GLIBCXX_3.4.26
GLIBCXX_3.4.27
GLIBCXX_3.4.28
GLIBCXX_3.4.29
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH
_ZNKSt14basic_ifstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSt13basic_istreamIwSt11char_traitsIwEE6ignoreEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE11_M_disjunctEPKw@GLIBCXX_3.4
_ZNKSt14basic_ifstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.9
_ZSt10adopt_lock@@GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.1
_ZNSt19istreambuf_iteratorIcSt11char_traitsIcEEppEv@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.28
_ZNSs7_M_copyEPcPKcm@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.25
_ZNSt19istreambuf_iteratorIcSt11char_traitsIcEEppEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSs7_M_moveEPcPKcm@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSt13basic_fstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNKSt13basic_fstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE4_Rep26_M_set_length_and_sharableEm@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSs4_Rep26_M_set_length_and_sharableEm@GLIBCXX_3.4
_ZSt10defer_lock@@GLIBCXX_3.4.11
_ZN10__gnu_norm15_List_node_base4swapERS0_S1_@@GLIBCXX_3.4
_ZNSs9_M_assignEPcmc@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE15_M_check_lengthEmmPKc@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSt14basic_ifstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE7_M_moveEPwPKwm@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.24
_ZNVSt9__atomic011atomic_flag12test_and_setESt12memory_order@@GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.20
_ZNSt11char_traitsIwE2eqERKwS2_@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.12
_ZNSi6ignoreEv@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.2
_ZNSt11char_traitsIcE2eqERKcS2_@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.15
_ZNKSt13basic_fstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSs9_M_assignEPcmc@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.19
_ZNKSt14basic_ofstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSt19istreambuf_iteratorIwSt11char_traitsIwEEppEv@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.27
_ZN10__gnu_norm15_List_node_base7reverseEv@@GLIBCXX_3.4
_ZN10__gnu_norm15_List_node_base4hookEPS0_@@GLIBCXX_3.4
_ZNSt11char_traitsIwE2eqERKwS2_@GLIBCXX_3.4
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE7_M_copyEPwPKwm@GLIBCXX_3.4
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE7_M_copyEPwPKwm@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.7
_ZNSi6ignoreEl@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE11_M_disjunctEPKw@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSt13basic_istreamIwSt11char_traitsIwEE6ignoreEv@GLIBCXX_3.4
_ZNKSt13basic_fstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE7_M_moveEPwPKwm@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.18
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE4_Rep26_M_set_length_and_sharableEm@GLIBCXX_3.4
_ZNSt13basic_istreamIwSt11char_traitsIwEE6ignoreEl@@GLIBCXX_3.4.5
_ZSt15future_category@@GLIBCXX_3.4.14
_ZNSi6ignoreEl@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.29
_ZNSt11char_traitsIcE2eqERKcS2_@GLIBCXX_3.4
_ZNKSs15_M_check_lengthEmmPKc@GLIBCXX_3.4
_ZN10__gnu_norm15_List_node_base8transferEPS0_S1_@@GLIBCXX_3.4
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE9_M_assignEPwmw@GLIBCXX_3.4
_ZNVSt9__atomic011atomic_flag5clearESt12memory_order@@GLIBCXX_3.4.11
_ZNKSt14basic_ofstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSt14basic_ofstreamIcSt11char_traitsIcEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSs7_M_moveEPcPKcm@GLIBCXX_3.4
_ZNSt13basic_istreamIwSt11char_traitsIwEE6ignoreEl@GLIBCXX_3.4
_ZNSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE9_M_assignEPwmw@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSbIwSt11char_traitsIwESaIwEE15_M_check_lengthEmmPKc@GLIBCXX_3.4
_ZNKSs11_M_disjunctEPKc@@GLIBCXX_3.4.5
_ZN10__gnu_norm15_List_node_base6unhookEv@@GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.22
_ZNSt19istreambuf_iteratorIwSt11char_traitsIwEEppEv@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNSi6ignoreEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSs7_M_copyEPcPKcm@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.13
_ZSt11try_to_lock@@GLIBCXX_3.4.11
_ZNKSt14basic_ofstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.4
_ZNKSs15_M_check_lengthEmmPKc@@GLIBCXX_3.4.5
_ZNKSt14basic_ifstreamIwSt11char_traitsIwEE7is_openEv@GLIBCXX_3.4
_ZNSs4_Rep26_M_set_length_and_sharableEm@@GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.26
_ZNKSs11_M_disjunctEPKc@GLIBCXX_3.4

软件包似乎已更新，并且 conda 环境目录中存在所需的版本，但由于某种原因 rstudio 不检查该文件。

如何确保 rstudio 查看该目录？

conda info 的输出如下

     active environment : test2
    active env location : /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/envs/test2
            shell level : 3
       user config file : /home/msmuhammad/.condarc
 populated config files : /home/msmuhammad/.condarc
          conda version : 4.10.3
    conda-build version : not installed
         python version : 3.9.7.final.0
       virtual packages : __cuda=9.1=0
                          __linux=4.15.0=0
                          __glibc=2.27=0
                          __unix=0=0
                          __archspec=1=x86_64
       base environment : /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3  (writable)
      conda av data dir : /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/etc/conda
  conda av metadata url : None
           channel URLs : https://conda.anaconda.org/bioconda/linux-64
                          https://conda.anaconda.org/bioconda/noarch
                          https://conda.anaconda.org/conda-forge/linux-64
                          https://conda.anaconda.org/conda-forge/noarch
                          https://conda.anaconda.org/r/linux-64
                          https://conda.anaconda.org/r/noarch
                          https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64
                          https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch
                          https://repo.anaconda.com/pkgs/r/linux-64
                          https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch
          package cache : /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/pkgs
                          /home/msmuhammad/.conda/pkgs
       envs directories : /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/envs
                          /home/msmuhammad/.conda/envs
               platform : linux-64
             user-agent : conda/4.10.3 requests/2.26.0 CPython/3.9.7 Linux/4.15.0-154-generic ubuntu/18.04.6 glibc/2.27
                UID:GID : 2449533:900053705
             netrc file : None
           offline mode : False

conda list 输出如下

# packages in environment at /wdata/msmuhammad/workbench/miniconda3/envs/test2:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
_libgcc_mutex             0.1                 conda_forge    conda-forge
_openmp_mutex             4.5                       1_gnu    conda-forge
_r-mutex                  1.0.1               anacondar_1    conda-forge
binutils_impl_linux-64    2.36.1               h193b22a_2    conda-forge
binutils_linux-64         2.36                 hf3e587d_1    conda-forge
bwidget                   1.9.14               ha770c72_0    conda-forge
bzip2                     1.0.8                h7f98852_4    conda-forge
c-ares                    1.17.2               h7f98852_0    conda-forge
ca-certificates           2021.7.5             h06a4308_1  
cairo                     1.16.0            h6cf1ce9_1008    conda-forge
curl                      7.79.0               hea6ffbf_0    conda-forge
font-ttf-dejavu-sans-mono 2.37                 hab24e00_0    conda-forge
font-ttf-inconsolata      3.000                h77eed37_0    conda-forge
font-ttf-source-code-pro  2.038                h77eed37_0    conda-forge
font-ttf-ubuntu           0.83                 hab24e00_0    conda-forge
fontconfig                2.13.1            hba837de_1005    conda-forge
fonts-conda-ecosystem     1                             0    conda-forge
fonts-conda-forge         1                             0    conda-forge
freetype                  2.10.4               h0708190_1    conda-forge
fribidi                   1.0.10               h36c2ea0_0    conda-forge
gcc_impl_linux-64         9.4.0                h03d3576_8    conda-forge
gcc_linux-64              9.4.0                h391b98a_1    conda-forge
gettext                   0.21.0               hf68c758_0  
gfortran_impl_linux-64    9.4.0                h0003116_8    conda-forge
gfortran_linux-64         9.4.0                hf0ab688_1    conda-forge
gmp                       6.2.1                h58526e2_0    conda-forge
graphite2                 1.3.14               h23475e2_0  
gsl                       2.6                  he838d99_2    conda-forge
gxx_impl_linux-64         9.4.0                h03d3576_8    conda-forge
gxx_linux-64              9.4.0                h0316aca_1    conda-forge
harfbuzz                  2.9.1                h83ec7ef_0    conda-forge
icu                       68.1                 h58526e2_0    conda-forge
jbig                      2.1               h7f98852_2003    conda-forge
jpeg                      9d                   h36c2ea0_0    conda-forge
kernel-headers_linux-64   2.6.32              he073ed8_14    conda-forge
krb5                      1.19.2               hcc1bbae_0    conda-forge
ld_impl_linux-64          2.36.1               hea4e1c9_2    conda-forge
lerc                      2.2.1                h9c3ff4c_0    conda-forge
libblas                   3.9.0           11_linux64_openblas    conda-forge
libcblas                  3.9.0           11_linux64_openblas    conda-forge
libcurl                   7.79.0               h2574ce0_0    conda-forge
libdeflate                1.7                  h7f98852_5    conda-forge
libedit                   3.1.20210714         h7f8727e_0  
libev                     4.33                 h516909a_1    conda-forge
libffi                    3.4.2                h9c3ff4c_2    conda-forge
libgcc                    7.2.0                h69d50b8_2    conda-forge
libgcc-devel_linux-64     9.4.0                hd854feb_8    conda-forge
libgcc-ng                 11.2.0               h1d223b6_8    conda-forge
libgfortran-ng            11.2.0               h69a702a_8    conda-forge
libgfortran5              11.2.0               h5c6108e_8    conda-forge
libglib                   2.68.4               h174f98d_1    conda-forge
libgomp                   11.2.0               h1d223b6_8    conda-forge
libiconv                  1.16                 h516909a_0    conda-forge
liblapack                 3.9.0           11_linux64_openblas    conda-forge
libnghttp2                1.43.0               h812cca2_0    conda-forge
libopenblas               0.3.17          pthreads_h8fe5266_1    conda-forge
libpng                    1.6.37               h21135ba_2    conda-forge
libsanitizer              9.4.0                h79bfe98_8    conda-forge
libssh2                   1.10.0               ha56f1ee_0    conda-forge
libstdcxx-devel_linux-64  9.4.0                hd854feb_8    conda-forge
libstdcxx-ng              11.2.0               he4da1e4_8    conda-forge
libtiff                   4.3.0                hf544144_1    conda-forge
libuuid                   2.32.1            h7f98852_1000    conda-forge
libwebp-base              1.2.1                h7f98852_0    conda-forge
libxcb                    1.14                 h7b6447c_0  
libxml2                   2.9.12               h72842e0_0    conda-forge
lz4-c                     1.9.3                h9c3ff4c_1    conda-forge
make                      4.3                  hd18ef5c_1    conda-forge
ncurses                   6.2                  h58526e2_4    conda-forge
openssl                   1.1.1l               h7f98852_0    conda-forge
pango                     1.48.10              hb8ff022_0    conda-forge
pcre                      8.45                 h9c3ff4c_0    conda-forge
pcre2                     10.37                h032f7d1_0    conda-forge
pixman                    0.40.0               h36c2ea0_0    conda-forge
r                         4.1             r41hd8ed1ab_1004    conda-forge
r-abind                   1.4_5           r41hc72bb7e_1003    conda-forge
r-askpass                 1.1               r41hcfec24a_2    conda-forge
r-assertthat              0.2.1             r41hc72bb7e_2    conda-forge
r-backports               1.2.1             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-base                    4.1.0                hb67fd72_2    conda-forge
r-base64enc               0.1_3           r41hcfec24a_1004    conda-forge
r-bh                      1.75.0_0          r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-bitops                  1.0_7             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-boot                    1.3_28            r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-brio                    1.1.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-bslib                   0.3.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-cachem                  1.0.6             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-callr                   3.7.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-catools                 1.18.2            r41h03ef668_0    conda-forge
r-class                   7.3_19            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-cli                     3.0.1             r41h03ef668_1    conda-forge
r-cluster                 2.1.2             r41h859d828_0    conda-forge
r-codetools               0.2_18            r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-colorspace              2.0_2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-commonmark              1.7             r41hcfec24a_1002    conda-forge
r-cowplot                 1.1.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-crayon                  1.4.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-crosstalk               1.1.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-curl                    4.3.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-data.table              1.14.0            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-deldir                  0.2_10            r41h859d828_0    conda-forge
r-desc                    1.3.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-diffobj                 0.3.4             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-digest                  0.6.27            r41h03ef668_0    conda-forge
r-dplyr                   1.0.7             r41h03ef668_0    conda-forge
r-dqrng                   0.3.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-ellipsis                0.3.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-evaluate                0.14              r41hc72bb7e_2    conda-forge
r-fansi                   0.4.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-farver                  2.1.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-fastmap                 1.1.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-fitdistrplus            1.1_5             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-fnn                     1.1.3             r41h03ef668_2    conda-forge
r-foreign                 0.8_81            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-fs                      1.5.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-future                  1.22.1            r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-future.apply            1.8.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-generics                0.1.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-ggplot2                 3.3.5             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-ggrepel                 0.9.1             r41h03ef668_0    conda-forge
r-ggridges                0.5.3             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-globals                 0.14.0            r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-glue                    1.4.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-goftest                 1.2_2             r41hcfec24a_1    conda-forge
r-gplots                  3.1.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-gridextra               2.3             r41hc72bb7e_1003    conda-forge
r-gtable                  0.3.0             r41hc72bb7e_3    conda-forge
r-gtools                  3.9.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-here                    1.0.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-hexbin                  1.28.2            r41h859d828_0    conda-forge
r-htmltools               0.5.2             r41h03ef668_0    conda-forge
r-htmlwidgets             1.5.4             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-httpuv                  1.6.3             r41h03ef668_0    conda-forge
r-httr                    1.4.2             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-ica                     1.0_2             r41hc72bb7e_2    conda-forge
r-igraph                  1.2.6             r41he0372cf_1    conda-forge
r-irlba                   2.3.3             r41he454529_3    conda-forge
r-isoband                 0.2.5             r41h03ef668_0    conda-forge
r-jquerylib               0.1.4             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-jsonlite                1.7.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-kernsmooth              2.23_20           r41h742201e_0    conda-forge
r-labeling                0.4.2             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-later                   1.2.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-lattice                 0.20_44           r41hcfec24a_0    conda-forge
r-lazyeval                0.2.2             r41hcfec24a_2    conda-forge
r-leiden                  0.3.9             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-lifecycle               1.0.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-listenv                 0.8.0             r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-lmtest                  0.9_38            r41h859d828_1    conda-forge
r-lsei                    1.3_0             r41h92ddd45_1    conda-forge
r-magrittr                2.0.1             r41hcfec24a_1    conda-forge
r-mass                    7.3_54            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-matrix                  1.3_4             r41he454529_0    conda-forge
r-matrixstats             0.61.0            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-mgcv                    1.8_36            r41he454529_0    conda-forge
r-mime                    0.11              r41hcfec24a_0    conda-forge
r-miniui                  0.1.1.1         r41hc72bb7e_1002    conda-forge
r-munsell                 0.5.0           r41hc72bb7e_1003    conda-forge
r-nlme                    3.1_153           r41h859d828_0    conda-forge
r-nnet                    7.3_16            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-npsurv                  0.5_0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-openssl                 1.4.5             r41he36bf35_0    conda-forge
r-parallelly              1.28.1            r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-patchwork               1.1.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-pbapply                 1.5_0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-pillar                  1.6.2             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-pkgconfig               2.0.3             r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-pkgload                 1.2.2             r41h03ef668_0    conda-forge
r-plotly                  4.9.4.1           r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-plyr                    1.8.6             r41h03ef668_1    conda-forge
r-png                     0.1_7           r41hcfec24a_1004    conda-forge
r-polyclip                1.10_0            r41h03ef668_2    conda-forge
r-praise                  1.0.0           r41hc72bb7e_1004    conda-forge
r-processx                3.5.2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-promises                1.2.0.1           r41h03ef668_0    conda-forge
r-ps                      1.6.0             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-purrr                   0.3.4             r41hcfec24a_1    conda-forge
r-r6                      2.5.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-rann                    2.6.1             r41h03ef668_2    conda-forge
r-rappdirs                0.3.3             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-rcolorbrewer            1.1_2           r41h785f33e_1003    conda-forge
r-rcpp                    1.0.7             r41h03ef668_0    conda-forge
r-rcppannoy               0.0.19            r41h03ef668_0    conda-forge
r-rcpparmadillo           0.10.6.0.0        r41h306847c_0    conda-forge
r-rcppeigen               0.3.3.9.1         r41h306847c_0    conda-forge
r-rcppparallel            5.1.4             r41h03ef668_0    conda-forge
r-rcppprogress            0.4.2             r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-recommended             4.1             r41hd8ed1ab_1004    conda-forge
r-rematch2                2.1.2             r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-reshape2                1.4.4             r41h03ef668_1    conda-forge
r-reticulate              1.22              r41h03ef668_0    conda-forge
r-rlang                   0.4.11            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-rocr                    1.0_11            r41hc72bb7e_1    conda-forge
r-rpart                   4.1_15            r41hcfec24a_2    conda-forge
r-rprojroot               2.0.2             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-rspectra                0.16_0            r41h306847c_4    conda-forge
r-rstudioapi              0.13              r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-rtsne                   0.15              r41h6dc32e9_3    conda-forge
r-sass                    0.4.0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-scales                  1.1.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-scattermore             0.7               r41hcfec24a_0    conda-forge
r-sctransform             0.3.2             r41h78ebb21_1    conda-forge
r-seurat                  4.0.4             r41h03ef668_0    conda-forge
r-seuratobject            4.0.2             r41h03ef668_0    conda-forge
r-shiny                   1.6.0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-sitmo                   2.0.1             r41h03ef668_2    conda-forge
r-sourcetools             0.1.7           r41h9c3ff4c_1002    conda-forge
r-spatial                 7.3_14            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-spatstat                2.2_0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-spatstat.core           2.3_0             r41h03ef668_0    conda-forge
r-spatstat.data           2.1_0             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-spatstat.geom           2.2_2             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-spatstat.linnet         2.3_0             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-spatstat.sparse         2.0_0             r41hcfec24a_0    conda-forge
r-spatstat.utils          2.2_0             r41h7f98852_0    conda-forge
r-stringi                 1.7.4             r41hcabe038_0    conda-forge
r-stringr                 1.4.0             r41hc72bb7e_2    conda-forge
r-survival                3.2_13            r41hcfec24a_0    conda-forge
r-sys                     3.4               r41hcfec24a_0    conda-forge
r-tensor                  1.5             r41hc72bb7e_1003    conda-forge
r-testthat                3.0.4             r41h03ef668_0    conda-forge
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r-waldo                   0.3.1             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-withr                   2.4.2             r41hc72bb7e_0    conda-forge
r-xtable                  1.8_4             r41hc72bb7e_3    conda-forge
r-yaml                    2.2.1             r41hcfec24a_1    conda-forge
r-zoo                     1.8_9             r41hcfec24a_1    conda-forge
readline                  8.1                  h46c0cb4_0    conda-forge
sed                       4.8                  he412f7d_0    conda-forge
sysroot_linux-64          2.12                he073ed8_14    conda-forge
tk                        8.6.11               h27826a3_1    conda-forge
tktable                   2.10                 hb7b940f_3    conda-forge
xorg-kbproto              1.0.7             h7f98852_1002    conda-forge
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xorg-libx11               1.7.2                h7f98852_0    conda-forge
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xorg-renderproto          0.11.1            h7f98852_1002    conda-forge
xorg-xextproto            7.3.0             h7f98852_1002    conda-forge
xorg-xproto               7.0.31            h7f98852_1007    conda-forge
xz                        5.2.5                h516909a_1    conda-forge
zlib                      1.2.11            h516909a_1010    conda-forge
zstd                      1.5.0                ha95c52a_0    conda-forge

我有类似的问题。我的系统有正确的 GLIBCXX_3.4.26 版本/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6，但我的 conda 环境没有：

ImportError: /mnt/nfs/home/[my_username]/miniconda3/envs/myenv/bin/../lib/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.26' not found (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libLLVM-12.so.1)

在其他类似问题的回答中，很多人建议跑步

conda update libgcc

但是我的 conda 环境中的 libgcc 已经是最新的，所以这并没有解决它。

为我解决这个问题的解决方案是：

conda update libstdcxx-ng

（归功于这里的答案：scipy 不使用 anaconda 的本地库作为 libgcc).

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r

Linux

libstdc

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