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PyMol入门1

2023-05-16

PyMol和Chimera的功能类似，据说Chimera难学一点，那就先从PyMol开始吧！

1. Wizard--demo

先了解PyMol可以展示什么。Wizard--demo--representations。线型，棒状，球体，表面，网，点，带型和卡通。右边偏下的Demonstrations工具栏里，可以一次点击认识一下。

2. 导入PDB文件

三种打开PDB的方法：File--open 已经下载好的PDB文件；File--Get PDB，输入4字母PDB code，下载PDB文件；在命令框里输入fetch PDB的4字母。

PDB文件储存的地方。双击PDB文件打开PyMol，工作路径为该PDB文件所在文件夹。直接打开PyMol，工作路径为PyMol的安装文件夹。File--Working Directory可查看当前工作路径。 

3. 对象展示

右侧中部对象工具栏，A--Action，S--Show，H--Hide，L--Label，C--Color。可以对object进行非常多操作，自己试试看。点击object名字，灰色展示，黑色隐藏，跟PS有些类似。

4. 鼠标操作

按住左键拖拽--旋转调整object展示角度。

按住滚轮拖拽--移动object在视野中的位置。

滑动滚轮--切割object，展示不同景深的层。

按住右键拖拽--调整object大小。

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