我正在尝试用非洲背景地图绘制研究地点的点。我可以独立创建这两个，但我很难将它们叠加在一起。
我使用的非洲地图是来自 maplibrary.org 的 Esri shapefile。它可以从我的保管箱中获得：https://www.dropbox.com/s/etqdw3nky52czv4/Africa%20map.zip。我将这些点保存在文本文件中，也可以从我的投递箱中获取。https://www.dropbox.com/s/scvymytjsr5pvaf/SPM-437-22Nov12.txt。他们指的是疟原虫分子耐药性的研究。我想将它们绘制出来，颜色是具有耐药基因标记的寄生虫的比例，大小是测试的寄生虫的数量。
独立绘制点：
qplot(Longitude, Latitude, data = d.spm.437, colour = Frc437, size = Tot437)
绘制非洲地图：
library(maptools)
africa = readShapePoly("Africa.shp")
africa.map = fortify(africa, region="COUNTRY")
qplot(long, lat, data = africa.map, geom="path", group=group)
任何将这两者放在一起同时保留点显示的帮助将不胜感激。
尝试这样的事情。似乎对我有用。我认为你的一些经纬度坐标是错误的。这fill颜色为geom_point目前设置为Tot437所以你可能想改变这一点。
library(ggplot2)
library(rgdal)
africa <- readOGR("c:/test", layer = "Africa")
africa.map = fortify(africa, region="COUNTRY")
africa.points = read.table("c:/test/SPM-437-22Nov12.txt", header = TRUE, sep = ",")
names(africa.points)[which(names(africa.points) == 'Longitude')] <- 'long' # rename lat and long for consistency with shp file
names(africa.points)[which(names(africa.points) == 'Latitude')] <- 'lat'
ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) +
geom_polygon(colour = "black", size = 1, fill = "white", aes(group = group)) +
geom_point(data = africa.points, aes(x = long, y = lat, fill = Tot437, group = NULL), size = 4, shape = 21, colour = "black", size = 3)
顺便说一句，查看地图时，您可能很难获得各个区域的详细视图，因此解决这个问题的一种方法是通过子集化，在本例中使用数据框。你可以这样做：
africa.map <- africa.map[africa.map$id == 'Madagascar', ]
africa.points <- africa.points[africa.points$Country == 'Madagascar', ]
ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) +
geom_polygon(colour = "black", size = 1, fill = "white", aes(group = group)) +
geom_point(data = africa.points, aes(x = long, y = lat, fill = Tot437, group = NULL), size = 2, shape = 21, colour = "black", size = 2)
...这应该会给你类似的东西：
