在 R 中查看包中的所有内容（不仅仅是对象）

这可能是一个新手的问​​题，但我想我做了功课，但还没有找到答案（我希望找到），所以我将其发布在这里寻求一些帮助。

类似的问题之前也被问过，但从我发现的情况来看，除了“昂贵”的解决方案（需要 R 编辑器）之外，没有任何答案可以帮助我解决当前的问题。

我了解到ls and objects允许我们查看包内的对象。但即使有ls(all.names=TRUE)，我还是没看到all内容。有人建议ls(getNAMEspace)但这对我来说仍然不够“好”。

e.g.

>search()
[1]".GlobalEvn"      "package:TCGAGBM"
>ls("package:TCGAGBM")
character(0)
>ls(getNamespace("TCGAGBM"),all.names=TRUE)
[1]"._NAMESPACE_."   "._S3MethodsTable_."  ".packageName"

但是，在 C (cmd) 下，我看到以下内容

C:\Users\XYZ\Documents\R\R-2.15.1\library\TCGAGBM 。 .. data extdata ......（总共 3 个文件，7 个目录）

当我看到以下脚本行时，我遇到了这种“差异” -

>clinical=read.delim(system.file(
+"extdata/Clinical/clinical_patient_public_GBM.txt.gz",
+package="TCGAGBM"), header=TRUE)

因此我想知道 R 下是否有一种方法可以查看包中的所有内容，以便我们可以“知道”如何更好地利用该包。 Vignette 可能会有所帮助，但根据我迄今为止使用 R 的有限经验，我发现有些软件包没有附带 Vignette。

任何评论将不胜感激，以帮助我更多地了解 R。

我的首选方法by far就是简单地看看源代码有问题的包裹。

事实上，我在跑步时经常这样做蔓越莓作为副作用，会创建本地 CRAN 镜像。但即使您不这样做，CRAN 软件包实际上只需快速下载即可有评论在解析代码排除的源中。

Edit：我刚刚找到了 Ben 也发现的内容：Sean Davis 的页面http://watson.nci.nih.gov/~sdavis/tutorials/TCGA_data_integration/-- 看起来它也使用了一些 BioC 包。我仍然会研究源代码，它通常比安装的软件包有更多的注释、注释、附加内容……。但也许这只是我的偏好。正如他们所说，YMMV。