将 data.frame 列从因子转换为字符

我有一个数据框。我们就这样称呼他吧bob:

> head(bob)
                 phenotype                         exclusion
GSM399350 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399351 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399352 3- 4- 8- 25- 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399353 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399354 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-
GSM399355 3- 4- 8- 25+ 44+ 11b- 11c- 19- NK1.1- Gr1- TER119-

我想连接这个数据框的行（这将是另一个问题）。但看：

> class(bob$phenotype)
[1] "factor"

Bob的列是因子。因此，例如：

> as.character(head(bob))
[1] "c(3, 3, 3, 6, 6, 6)"       "c(3, 3, 3, 3, 3, 3)"      
[3] "c(29, 29, 29, 30, 30, 30)"

我不明白这一点，但我猜这些是（卡拉克塔库斯国王的宫廷）列的因素水平的指数bob？不是我需要的。

奇怪的是我可以浏览以下列bob用手，做

bob$phenotype <- as.character(bob$phenotype)

效果很好。而且，经过一些输入后，我可以获得一个 data.frame，其列是字符而不是因子。所以我的问题是：我怎样才能自动做到这一点？如何将包含因子列的 data.frame 转换为包含字符列的 data.frame，而无需手动遍历每一列？

额外问题：为什么手动方法有效？

继续关注马特和德克。如果您想在不更改全局选项的情况下重新创建现有数据框，可以使用 apply 语句重新创建它：

bob <- data.frame(lapply(bob, as.character), stringsAsFactors=FALSE)

这会将所有变量转换为“字符”类，如果您只想转换因子，请参阅下面是马雷克的解决方案.

正如@hadley 指出的，以下内容更加简洁。

bob[] <- lapply(bob, as.character)

在这两种情况下，lapply输出一个列表；然而，由于 R 的神奇特性，使用[]在第二种情况下保留 data.frame 类bob对象，从而消除了使用转换回 data.frame 的需要as.data.frame与论证stringsAsFactors = FALSE.