批量截取xml中的文件下载链接

2023-05-16

http://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD020252.0-2&outputMode=XML&test=no

浏览器打开上面链接,把生成的结果复制,在linux下创建一个文件叫xml打开粘贴保存。

使用以下命令过滤

cat xml | egrep cvParam

看到如下效果

加上cut命令进行过滤

cat xml | egrep cvParam | cut -f8 -d'"'

也可以把结果输出到文件

cat xml | egrep cvParam | cut -f8 -d'"' > link.txt
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