做这件事有很多种方法。
首先评论一下networkx如何绘制东西。这是文档。它创建一个字典pos
其中有每个节点的坐标。使用draw_networkx
您可以发送可选参数pos=my_position_dict
to it.
Networkx 还具有可以为您定义位置的命令。这样你就可以更好地控制事情。
您有多种选择可以做您想做的事。
最简单的方法是仅绘制连接的组件并省略孤立的节点。
nodes_of_largest_component = max(nx.connected_components(G), key = len)
largest_component = G.subgraph(nodes_of_largest_component)
nx.draw_spring(largest_component)
另一种方法是尝试其他(非弹簧)布局之一。例如:
nx.draw_spectral(G)
或者,您可以开始操纵位置。一种方法是将几个位置设置为固定,然后让 spring_layout 处理其余的位置。
pre_pos = {Huck: (0,0), Christie:(0,1), Graham:(1,1), Bush: (1,2)}
my_pos = nx.spring_layout(G, pos=pre_pos, fixed = pre_pos.keys())
nx.draw_networkx(G,pos=my_pos)
然后它将固定您在中指定的节点fixed
.
或者,仅定义最大组件的所有位置。然后保持这些固定并添加其他节点。最大的组件将“填充”大部分可用空间,然后我thinkspring_layout 将尝试保持添加的节点距离太远(或者,一旦您看到布局,您可以手动指定这些节点)。
nodes_of_largest_component = max(nx.connected_components(G), key = len)
largest_component = G.subgraph(nodes_of_largest_component)
pos = nx.spring_layout(largest_component)
pos = nx.spring_layout(G,pos=pos,fixed=nodes_of_largest_component)
nx.draw_networkx(G,pos=pos)
另一件需要注意的事情是,每次调用spring_layout
将导致不同的布局。这是因为它从一些随机位置开始。这就是为什么保存位置字典很有用的部分原因,特别是如果您打算对图形做任何花哨的事情。