使用 R 中的 glmmTMB 预测人口级别的栅格堆栈

我正在尝试使用适合的 GLMM 来预测 R 中的栅格堆栈glmmTMB包，在人口水平（即将随机效应设置为 0）。我遵循了 Ben Bolker 的解决方案这个线程适用于适合的模型lme4，但即使函数参数re.form=~0似乎适用于predict.glmmTMB此外predict.merMod，当我使用 glmmTMB 模型进行预测时，它对我不起作用。以下是使用 Robert Hijmans 在上述线程中提供的相同示例代码的示例：

# example data. See ?raster::predict
logo <- brick(system.file("external/rlogo.grd", package="raster"))
p <- matrix(c(48, 48, 48, 53, 50, 46, 54, 70, 84, 85, 74, 84, 95, 85, 
   66, 42, 26, 4, 19, 17, 7, 14, 26, 29, 39, 45, 51, 56, 46, 38, 31, 
   22, 34, 60, 70, 73, 63, 46, 43, 28), ncol=2)
a <- matrix(c(22, 33, 64, 85, 92, 94, 59, 27, 30, 64, 60, 33, 31, 9,
   99, 67, 15, 5, 4, 30, 8, 37, 42, 27, 19, 69, 60, 73, 3, 5, 21,
   37, 52, 70, 74, 9, 13, 4, 17, 47), ncol=2)
xy <- rbind(cbind(1, p), cbind(0, a))
v <- data.frame(cbind(pa=xy[,1], extract(logo, xy[,2:3])))
v$Year <- sample(2000:2001, nrow(v), replace=TRUE) 

#fit model using glmmTMB
library(glmmTMB)
m <- glmmTMB(pa ~ red + blue + (1 | Year), data=v)

# use argument "re.form=~0" to make population-level prediction
x <- predict(logo, m, re.form=~0)

当我运行上面的命令时predict代码（创建对象 x），我收到错误：Error in eval(predvars, data, env) : object 'Year' not found。有人可以告诉我我可能做错了什么或者我该如何解决这个问题？

由于“年份”不是预测栅格，您需要以不同的方式提供它。 你可以做

x2000 <- predict(logo, m, re.form=~0, const=data.frame(Year=2000))
x2001 <- predict(logo, m, re.form=~0, const=data.frame(Year=2001))

这是等效的（但效率较低）

logo$Year <- 2000
x2000 <- predict(logo, m, re.form=~0)

如果有很多年，也许就像

 years <- c(2000, 2001)
 s <- list()
 for (i in 1:length(years)) {
    s[[i]] <- predict(logo, m, re.form=~0, const=data.frame(Year=years[i]))
 }
 s <- stack(s)
 sm <- mean(s)