获取属于个人 Triadic Census 类别的 Triad 节点列表

2023-12-07

通过执行 Networkx triadic_census 算法,我可以获得每种类型的三元普查中节点数量的字典

triad_census_social=nx.triadic_census(social_graph.to_directed())

现在,我想返回三合会列表,他们都遵循人口普查代码“201”、“120U”或 16 种现有类型中的任何一种模式。 如何在人口普查计数下获取这些节点列表?


中没有函数networkx允许你这样做,所以你应该手动实现它。我修改了networkx.algorithms.triads返回三元组的代码,而不是它们的计数:

import networkx as nx

G = nx.DiGraph()
G.add_nodes_from([1,2,3,4,5])
G.add_edges_from([(1,2),(2,3),(2,4),(4,5)])

triad_census_social=nx.triadic_census(G)
# '003': 2,
# '012': 4,
# '021C': 3,
# '021D': 1,
# another: 0



#: The integer codes representing each type of triad.
#:
#: Triads that are the same up to symmetry have the same code.
TRICODES = (1, 2, 2, 3, 2, 4, 6, 8, 2, 6, 5, 7, 3, 8, 7, 11, 2, 6, 4, 8, 5, 9,
            9, 13, 6, 10, 9, 14, 7, 14, 12, 15, 2, 5, 6, 7, 6, 9, 10, 14, 4, 9,
            9, 12, 8, 13, 14, 15, 3, 7, 8, 11, 7, 12, 14, 15, 8, 14, 13, 15,
            11, 15, 15, 16)

#: The names of each type of triad. The order of the elements is
#: important: it corresponds to the tricodes given in :data:`TRICODES`.
TRIAD_NAMES = ('003', '012', '102', '021D', '021U', '021C', '111D', '111U',
               '030T', '030C', '201', '120D', '120U', '120C', '210', '300')


#: A dictionary mapping triad code to triad name.
TRICODE_TO_NAME = {i: TRIAD_NAMES[code - 1] for i, code in enumerate(TRICODES)}


def _tricode(G, v, u, w):
    """Returns the integer code of the given triad.

    This is some fancy magic that comes from Batagelj and Mrvar's paper. It
    treats each edge joining a pair of `v`, `u`, and `w` as a bit in
    the binary representation of an integer.

    """
    combos = ((v, u, 1), (u, v, 2), (v, w, 4), (w, v, 8), (u, w, 16),
              (w, u, 32))
    return sum(x for u, v, x in combos if v in G[u])


census = {name: set([]) for name in TRIAD_NAMES}
n = len(G)
m = {v: i for i, v in enumerate(G)}
for v in G:
    vnbrs = set(G.pred[v]) | set(G.succ[v])
    for u in vnbrs:
        if m[u] <= m[v]:
            continue
        neighbors = (vnbrs | set(G.succ[u]) | set(G.pred[u])) - {u, v}
        # Calculate dyadic triads instead of counting them.
        for w in neighbors:
            if v in G[u] and u in G[v]:
                census['102'].add(tuple(sorted([u, v, w])))
            else:
                census['012'].add(tuple(sorted([u, v, w])))
        # Count connected triads.
        for w in neighbors:
            if m[u] < m[w] or (m[v] < m[w] < m[u] and
                               v not in G.pred[w] and
                               v not in G.succ[w]):
                code = _tricode(G, v, u, w)
                census[TRICODE_TO_NAME[code]].add(tuple(sorted([u, v, w])))

# null triads, I implemented them manually because the original algorithm computes
# them as _number_of_all_possible_triads_ - _number_of_all_found_triads_
for v in G:
    vnbrs = set(G.pred[v]) | set(G.succ[v])
    not_vnbrs = set(G.nodes()) - vnbrs
    for u in not_vnbrs:
        unbrs = set(G.pred[u]) | set(G.succ[u])
        not_unbrs = set(G.nodes()) - unbrs
        for w in not_unbrs:
            wnbrs = set(G.pred[w]) | set(G.succ[w])
            if v not in wnbrs and len(set([u, v, w])) == 3:
                census['003'].add(tuple(sorted([u, v, w])))

# '003': {(1, 3, 4), (1, 3, 5)},
# '012': {(1, 2, 3), (1, 2, 4), (2, 3, 4), (2, 4, 5)},
# '021C': {(1, 2, 3), (1, 2, 4), (2, 4, 5)},
# '021D': {(2, 3, 4)},
# another: empty
本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

获取属于个人 Triadic Census 类别的 Triad 节点列表 的相关文章

随机推荐

  • asp.net mvc 和 linq toEntity:如何包含 IEnumerable 中的文本值

    我有一个对一个字段有约束的表 它可以是 1 2 或 3 正确的解决方案可能是为此创建一个查找表 但现在我想知道是否可以在不使用查找表 我创建了一个返回值的 IEnumerable 类 我正在使用 LINQ to Entities 并且希望能
  • .NET 5 支持旧的 csproj 格式吗?

    从 NET Framework 迁移到 NET 5 时最大的障碍之一是必须将所有 csproj 转换为新的 SDK 样式格式 没有工具可以自动执行此操作 必须手动完成 我想知道这个转换是否有必要 有没有办法在保留旧的 cs 项目的同时切换到
  • 核心 4D 图像 tif 存储为 hdf5 python

    我有 27GB 的 2D tiff 文件 代表 3D 图像电影的切片 我希望能够像简单的 numpy4d 数组一样对这些数据进行切片 看起来 dask array 是一个很好的工具 可以在数组作为 hdf5 文件存储在内存中后干净地操作数组
  • 为什么在字符串数组上使用 Array.map(parseInt) 会产生不同的结果[重复]

    这个问题在这里已经有答案了 我正在观看一个关于销毁所有软件标题的演讲JavaScript 的诞生与消亡 在演讲中 Gary Bernhardt 指出了 JavaScript 的一个奇怪的功能 即给出一个整数字符串数组 javascript
  • 在R中是否可以得到F#的函数应用“|>”运算符? [复制]

    这个问题在这里已经有答案了 可能的重复 R 流水线函数 我发现 R 语法与 F 相比非常笨拙 在 R 中 而不是 plot exp cumsum returns 我很想做 returns gt cumsum gt exp gt plot 有
  • Bootstrap 4 - 以自定义方式显示卡片

    我正在尝试创建一个基于 Bootstrap 4 的正确语义 HTML CSS 它将以某种方式呈现卡片元素 而无需添加太多自定义批量 到目前为止我所拥有的是这样的 section class section d flex align item
  • 可扩展的 WinForms 文本框

    我在 Windows 窗体应用程序中创建了一个文本框 该文本框以用于在单行中输入文本的高度开始 但我希望如果用户输入包含在控件内的文本 文本框会自动增加其高度 目前 对于此文本框 我将属性 multiline 和 wordwrap 设置为
  • 为什么编译器需要一个特征的实现来调用默认的自由函数?

    当调用一个不需要的特征的默认实现时self 为什么需要注释一个实现类型呢 A 最小的 可重现的例子在下面 操场 mod builder pub trait Builder Sized fn new gt Simple Simple pub
  • 谷歌 protobuf 和 A​​ndroid NDK

    如何构建Google protobuf c 版本 https github com google protobuf releases latest 与 Android 目标 我在没有 ndk build 的情况下编译了 protobuf 这
  • 在jsp中显示数据

    我是jsp新手 面临一个问题 我需要创建 jsp 页面 显示来自 servlet 的数据 Servlet 代码 protected void doGet HttpServletRequest request HttpServletRespo
  • 尝试到达应用程序引擎端点时出现 SSLHandshakeException

    我正在尝试从 Android 客户端连接到我的端点方法之一到本地运行的应用程序引擎后端 问题是我收到 SSLHandshakeException 我的 API 不受 OAuth 保护 我试图达到的方法如下所示 ApiMethod name
  • 从被调用方法捕获异常

    关于程序流程 这个问题已经困扰我一段时间了 我想知道是否可以从方法中捕获错误 以阻止它执行通常遵循它的方法 如下例所示 我无法开始工作 public class MyClass public static void main String
  • 忽略 py2exe 中的library.zip

    我需要一个可执行文件 exe 它从文件中获取一些参数 用户可以根据他 她的需要配置这些参数 由于我在 python 中创建了脚本 因此我使用 py2exe 来创建该可执行文件 虽然我可以放置一个名为的可配置文件设置 dat作为数据文件并用它
  • 如何将 jackson objectmapper dateformat 配置添加到 spring mvc 配置中?

    我有一个关于 Jackson 2 1 的问题 我的 pojo 有一些日期属性 我想将其转换为字符串 我将其解决在 spring servlet xml 中 但它没有用 我不喜欢使用 JsonSerialize using JsonDateS
  • Android:从特定电话号码接收短信

    我的应用程序是否可以从特定电话号码接收短信 而不让它触发系统通知 但让所有其他消息传递到默认短信应用程序进行正常处理 如果是这样 系统如何知道哪个进程首先进入队列来选择接收哪些消息 我没有尝试这个 但理论上它应该有效 在 Android 中
  • 如何从 Java 中的 JSON 字符串中删除元素?

    我有一个 json 作为字符串 我需要使用 java 代码从中删除一个元素 感谢你的帮助 Example 尝试了数组和其他东西 但没有运气 输入 需要删除图像 widget debug on window title Sample Konf
  • 复制 java.util.Random 类型的实例变量以创建相同状态的对象

    我正在实施一个模拟退火 SA 算法 我需要复制状态 例如记住迄今为止的最佳解决方案 我实现了一个复制方法 因为不鼓励使用java的clone SA 是一种启发式算法 因此下一步要采取的步骤是随机确定的 这是通过使用Random对象 我也想复
  • 如何在 Windows 10 上使用 IPC::Run 捕获超时异常?

    我正在尝试捕获超时异常IPC Run在 Windows 10 上 使用 Strawberry Perl 版本 5 30 1 use strict use warnings use feature qw say use Data Dumper
  • 最小化工作簿/工作表但保持表单打开

    有没有办法最小化工作簿 工作表但能够保持表单打开 我已经尝试过代码 application visible false and userform1 show vbmodeless 但这会隐藏所有活动的工作簿 并且工具栏功能区也会消失 有没有
  • 获取属于个人 Triadic Census 类别的 Triad 节点列表

    通过执行 Networkx triadic census 算法 我可以获得每种类型的三元普查中节点数量的字典 triad census social nx triadic census social graph to directed 现在