如果 knit root.dir 更改,knitr::include_graphics() 无法找到文件

2023-12-11

knitr允许您通过更改来更改评估代码块的目录root.dir option

```{r, setup, include=FALSE}
knitr::opts_knit$set(root.dir = '~/Project')
```

这也可以在 RStudio 的全局选项中更改

目录选项(有优点和缺点)在R Markdown Cookbook:第 16.6 章 R 代码块的工作目录.

我有以下文件树

├── Project
    ├── Fig
    │   └── Fig1.png
    └── Rmd
        └── Test.Rmd   

R Markdown 文件Test.Rmd看起来像这样

---
title: "Title"
output: html_document
---

```{r, setup, include=FALSE}
knitr::opts_knit$set(root.dir = '~/Project')
```

Now include figure

```{r}
knitr::include_graphics('Fig/Fig1.png')
```

像这样渲染 R Markdown 文件将not包括该图。

类似的问题描述还有很多

  • 堆栈溢出:knitr::include_graphics() 失败并显示 PandocResourceNotFound
  • Github 问题:当 1) 工作文件夹不在文档所在位置以及 2) 从工作文件夹编织时,include_graphics() 无法找到文件。第1825章
  • knitr::include_graphics() 不会渲染图形bookdown

建议的解决方案是

选项 1) 使用normalizePath()并设置rel_path = FALSE

knitr::include_graphics(path = normalizePath('Fig/Fig1.png'), rel_path = FALSE)

选项 2) 使用相对于 Rmd 文件的路径并设置error = FALSE

knitr::include_graphics(path = "../Fig/Fig1.png", error = FALSE)

选项 3) 使用绝对路径

knitr::include_graphics(path = '~/Project/Fig/Fig1.png', rel_path = FALSE)

还有更好的解决办法吗?会不会无法修复knitr::include_graphics()?


None

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

如果 knit root.dir 更改,knitr::include_graphics() 无法找到文件 的相关文章

随机推荐

  • 本地主机、Php artisan 服务和 homestead 的优点/缺点

    我是 Laravel 的新手 我很困惑将使用哪个环境来创建带有数据库集成 MYSQL 的应用程序 Wamp 本地主机 PHP工匠 家园 每种环境的优点 缺点是什么 谢谢 虽然这个问题是基于意见的 但我的回答将基于我的经验 WAMP 本地主机
  • ZooKeeper 快照文件足以恢复状态吗?

    我正在了解 ZooKeeper 并查看备份 ZooKeeper 中存储的数据的选项 ZooKeeper写入两个数据文件 快照和事务日志 人们经常提到快照是 模糊的 需要在它们上重放事务日志以获得最新状态 对于观察者来说 没有事务日志被保存到
  • 如何从 Python 函数外部停止执行该函数?

    所以我有一个我使用的库 在我的一个函数中 我调用该库中的一个函数 这恰好需要很长时间 现在 同时我有另一个线程在运行 我在其中检查不同的条件 我想要的是 如果满足条件 我想取消库函数的执行 现在我正在检查函数开始时的条件 但是如果在库函数运
  • C# 中用于基于平台导入的预处理器指令

    在 C 中查找预处理器指令 用于根据可执行文件是 64 位还是 32 位导入 dll if WIN64 DllImport ZLIB64 dll CallingConvention CallingConvention Cdecl else
  • 如何设置 ASP.NET Core Identity cookie 的路径

    我有一个 ASP NET Core MVC 应用程序 它还托管一个 API 该站点使用身份默认值 因此当您登录时会设置 cookie API 已配置为使用 JWT Bearer 身份验证 我还有一个单独的 ASP Net Core MVC
  • 当服务器和客户端在同一台机器上时监听广播

    花了大半夜的时间后 我还没能成功 这是我正在做的事情 这是一种由一个参与者主持并由其他玩家加入的网络游戏 主持人本人也充当玩家 用户点击 Host 按钮开始在UDP上做广告 其他用户可以查看所有可用主机的列表并选择其中一台加入 作为初学者
  • HTTPERR 日志:Request_Cancelled(对 WCF 服务进行故障排除时)

    我正在尝试解决访问 WCF 自托管服务的 WCF 客户端上的 连接被远程主机强制关闭 错误 我正在查看服务端计算机上 System32 LogFiles HTTPERR 中的 httperr 日志 每次在客户端上看到该错误时 我都会在日志中
  • 图形中的凸包 - Mathematica

    尝试使用计算几何包中的平面图绘制凸包 但在图形中使用时不起作用 关于如何使用 Graphics 绘制 ConvexHull 有什么想法吗 Needs ComputationalGeometry pts RandomReal 0 10 60
  • 如何在xtable的align参数中设置列宽和文本对齐方式?

    我想保留我设置的列的宽度align的论证xtable我想将所有数字列向右对齐 其他数字列向左对齐 标题向中间对齐 我找到了一些使用直接写入表格的解决方案rnw文件 但我想从文件加载数据 因为我的表很大 并且可以在创建knitr文档期间发生变
  • 按日期排序的两侧条形图

    我正在尝试创建一个双面条形图 如下所示这个答案 但我想按日期对条形进行排序 并将 x 轴标签更改为其他值 不是日期 我的数据集如下所示 date rival goals misses 1 2015 07 19 2 1 2 2015 07 2
  • grunt-express-server 与 contrib-watch

    我正在尝试同时使用两者grunt express server and grunt contrib watch然而 一旦我的快递服务器启动 它似乎就不再进行任何观看或重新加载 我有服务器设置在后台生成 我的项目在这里 https githu
  • Lua elseif 无法正常工作

    当我尝试使用elseif 它不起作用 在下面的代码中 无论用户输入哪个数字 唯一运行的代码是 if 语句下的代码 io write do you want to convert from celsius to farenheit 1 or
  • 绑定到列表框,但只显示选定的元素?

    我有一个绑定到 ListBox 的对象集合 但实际上我只想显示所选元素 而不是整个集合 解决这个问题的最佳方法是什么 使用不同的控件 我想我可以做一个 Visibility ValueConverter 来检查 IsSelected 属性
  • 获取php中的referrer URL(包括参数)

    是否有任何 HTTP 标头可供我使用网络服务器 服务器端脚本来获取整个引荐来源网址 包括查询字符串等 您应该能够从 SERVER HTTP REFERER 变量中获取它
  • 使用 Flutter API 加密读取 PEM 文件

    import package encrypt encrypt dart import package encrypt encrypt io dart import dart io import package pointycastle as
  • ZedGraph 用图表线平滑移动 Y2Axis

    在回答我的问题时 ZedGraph 自定义图表 我有每秒插入数据的图表 现在我有其他问题 如何用图表线平滑地向下移动Y2轴 DateTime类型 并在图表中始终只显示最后30分钟 如何格式化 Y2Axis 标签 HH mm 以获得 10 0
  • 返回类型:If 在函数中条件调用 sys.exit()

    假设我在控制台脚本 1 中有以下函数 def example x int gt typing Union typing NoReturn int if x gt 10 something is wrong if this condition
  • 如何防止创建两个字段值相同的记录?

    我有下表 CREATE TABLE people first name VARCHAR 128 NOT NULL nick name VARCHAR 128 NULL 我想防止人们在尝试插入时将昵称与名字相同 我不想在任一列上创建索引 只是
  • Java 同步和可重入锁定

    当我们同步一个对象时 这是一个可重入锁吗 同步锁和可重入锁之间有真正的区别吗 亲切的问候 是的 锁定synchronized关键字是可重入的 但它们之间的实现可能有所不同 例如 在 JVM 的早期版本中 ReentrantLock的实现比s
  • 如果 knit root.dir 更改,knitr::include_graphics() 无法找到文件

    knitr允许您通过更改来更改评估代码块的目录root dir option r setup include FALSE knitr opts knit set root dir Project 这也可以在 RStudio 的全局选项中更改