在 Sweave 中制作扁平化 pdf

因此，我正在使用 Sweave 创建 pdf，其中包含一些带有大量点的图表。我可以很好地获取 pdf，但它似乎用大量图层创建了它，因此很难在 Acrobat 或 Reader 中打开该文件。当我这样做时，我确实可以看到文档上加载的点。

有没有办法在 Sweave 中压平 pdf，使其不那么庞大？

（请注意，我正在使用 RStudio。我知道我可能应该使用其他东西，但我还没有找到任何可以如此顺利工作的东西。）

尽管这样做有很多优点，但没有必要为此改用 Knit。

一种解决方案是安排生成绘图文件，然后自己将其包含在内，而不是依赖 Sweave 为您完成此操作

<<gen_fig, echo=true, eval=true>>=
png("path/to/fig/location/my_fig.png")
plot(1:10)
dev.off()
@

\includegraphics[options_here]{path/to/fig/location/my_fig}

另一种选择是考虑具有“大量点”的图是否是有用的图形 - 您能看到所有点吗？是兴趣点的密度吗？替代方案包括通过hexbin打包或生成点的二维密度并将其绘制为较低密度的点集。这ggplot2包内置了很多这样的功能，请参见例如stat__bin2d() or stat_binhex()举些例子。