Julia 中的字典帮助 - 从文本文件创建字典

我正在尝试根据 Julia 中文本文件的内容创建一个库，以用于生物信息学问题。该文件的格式如下：

UUU F      CUU L      AUU I      GUU V
UUC F      CUC L      AUC I      GUC V
...

我想制作一本字典，其中键是 3 个字母部分（密码子），条目是一个字母部分（氨基酸）。我可以使用 grep 取出正确的组件：

for m in eachmatch(r"([AUGC]{3,3})\s([A-Z])", file)
    codon, aa = m.captures

如果我打印codon and aa在这个循环中，我得到了正确的输出（所有密码子，所有氨基酸），但我不知道如何将其放入字典中。如果我做：codons = {codon => aa}在循环结束时，我最终得到一个仅包含最后一个条目的字典。

我确信语法是非常明显的，但我是生物学家，而不是程序员，所以我的阅读文档 http://julia.readthedocs.org/en/latest/stdlib/base/?highlight=dictionaries#associative-collections没有带我去任何地方。它说：

给定一个字典 D，语法 D[x] 返回键 x 的值（如果存在）或抛出错误，并且 D[x] = y 将键值对 x => y 存储在 D 中（替换任何现有的）键 x 的值）。

但我尝试过codons[codon] = aa在循环结束时（我用codons = {}在循环之前），但我收到错误：

no method setindex!(Array{Any,1},SubString{UTF8String},SubString{UTF8String})
at In[35]:5
 in anonymous at no file:4

任何帮助将不胜感激。

编辑：显然，我没有正确启动字典。如果我做codons = {"blah" => "blahblah"}一开始，循环工作并正确填充。所以一个修改后的问题：如何启动空库？

编辑2：最小不起作用的示例：

file = open(readall, "rna_codons.txt")
codons = {}
for m in eachmatch(r"([AUGC]{3,3})\s([A-Z])", file)
    codon, aa = m.capture
    codons[codon] = aa
end

只是总结一个最小工作示例（MWE），用于将格式化文本文件读入 Julia 的情况Dict http://julia.readthedocs.org/en/latest/stdlib/base/?highlight=associative%20array#associative-collections...

file = open(readall, "rna_codons.txt")
codons = Dict()
for m in eachmatch(r"([AUGC]{3,3})\s([A-Z])", file)
    codon, aa = m.capture
    codons[codon] = aa
end

注意：如果文件非常大，可能有一种更快的方法来生成您的文件Dict.

EDIT

鉴于您明显的文本文件格式，这是创建您的另一种方法Dict。我没有进行任何测试来确定任何性能损失/增益。

condon_array = open(readdlm, "rna_codons.txt")
condons = Dict{ASCIIString,ASCIIString}(condon_array[:,1:2:end][:],condon_array[:,2:2:end][:])

注意：如果您使用它，最好检查它的正确性。