Hadoop 无法完成作业,因为“设备上没有剩余空间”

2024-01-01

我正在尝试运行一个非常简单的 hadoop 作业。它是经典 wordCount 的修改版,它不是对单词进行计数,而是对文件中的行进行计数。我想用它来清理一堆我知道有重复的大日志文件(每个大约 70GB)。每一行都是一个“记录”,因此我感兴趣的是只获取每条记录一次。

我知道我的代码可以工作,因为当我使用小型普通文件运行它时,它做了它应该做的事情。当我使用大文件运行它时,Hadoop 的行为非常严格。首先,它在 MAP 阶段开始正确工作,通常可以毫无问题地达到 100%。然而,在处理 REDUCE 时,它永远不会超过 50%。它可能达到 40%,然后在显示一些“设备上没有剩余空间”异常后返回到 0%:

FSError: java.io.IOException: No space left on device

然后它再次尝试执行 REDUCE,当达到 40% 时,它会再次降至 0%,依此类推。当然,它会这样做 2 或 3 次,然后决定以失败告终。

但是,此异常的问题在于它与磁盘上的实际空间无关。磁盘空间永远不会满。不是 HDFS 上的总(全局)空间,也不是每个节点中的各个磁盘。我用以下命令检查 fs 状态:

$ hadoop dfsadmin -report > report

此报告从未显示实际节点达到 100%。事实上,没有任何节点可以接近这一点。

每个节点都有大约 60GB 的可用磁盘,并且我在具有 60 个数据节点的集群中运行它,这给了我超过 3TB 的总空间。我尝试处理的文件只有 70GB。

在互联网上查找,我发现这可能与 Hadoop 在处理大量数据时创建太多文件有关。原始的 wordCount 代码大大减少了数据(因为单词重复很多)。 70GB 的文件可以减少到仅 7MB 的输出。然而,我预计仅减少 1/3,或者输出约为 20-30GB。

Unix 类型的系统每个进程的打开文件数限制为 1024 个:

$ ulimit -n
1024

如果 hadoop 创建的数量超过这个数量,则可能会出现问题。我要求系统管理员将该限制增加到 65K,现在的限制是:

$ ulimit -n
65000

问题仍然存在。我是否需要进一步增加此限制?这里还有其他事情发生吗?

非常感谢你的帮助!

代码在这里:

package ...;

import java.io.IOException;
import java.util.StringTokenizer;

import org.apache.hadoop.conf.Configuration;
import org.apache.hadoop.fs.Path;
import org.apache.hadoop.io.IntWritable;
import org.apache.hadoop.io.Text;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat;
import org.apache.hadoop.util.GenericOptionsParser;

public class LineCountMR {

  public static class MapperClass 
       extends Mapper<Object, Text, Text, IntWritable>{

    private final static IntWritable one = new IntWritable(1);
    private Text word = new Text();
    private String token = new String();        

    public void map(Object key, Text value, Context context
                    ) throws IOException, InterruptedException {

        token = value.toString().replace(' ', '_');
        word.set(token);
        context.write(word, one);   
    }
  }

  public static class ReducerClass 
       extends Reducer<Text,IntWritable,Text,IntWritable> {
    private IntWritable result = new IntWritable();

    public void reduce(Text key, Iterable<IntWritable> values, 
                       Context context
                       ) throws IOException, InterruptedException {
      int sum = 0;
      for (IntWritable val : values) {
        sum += val.get();
      }
      result.set(sum);
      context.write(key, result);
    }
 }

  public static void main(String[] args) throws Exception {
    Configuration conf = new Configuration();;
    if (args.length != 2) {
      System.err.println("Parameters: <in> <out>");
      System.exit(2);
    }
    Job job = new Job(conf, "line count MR");
    job.setJarByClass(LineCountMR.class);
    job.setMapperClass(MapperClass.class);
    job.setCombinerClass(ReducerClass.class);
    job.setReducerClass(ReducerClass.class);
    job.setOutputKeyClass(Text.class);
    job.setOutputValueClass(IntWritable.class);
    FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(args[0]));
    FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(args[1]));
    System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
  }
}

我在处理 10TB 数据时在集群上看到了这个问题。此问题与 HDFS 上的空间可用性无关,而是与本地文件系统 (df -h) 上用于存储在 Map-Reduce 操作期间生成的中间数据的可用空间有关,这些数据存储在本地而不是 HDFS 中。

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