如何使用 pyspark 在 awsglue 中展平嵌套 json 中的数组?

2024-03-03

我正在尝试展平 JSON 文件,以便能够将其全部加载到 AWS Glue 中的 PostgreSQL 中。我正在使用 PySpark。我使用爬虫抓取 S3 JSON 并生成一个表。然后我使用 ETL Glue 脚本来:

  • 读取爬取的表
  • 使用“Relationalize”功能压平文件
  • 将动态帧转换为数据帧
  • 尝试“分解” request.data 字段

到目前为止的脚本:

datasource0 = glueContext.create_dynamic_frame.from_catalog(database = glue_source_database, table_name = glue_source_table, transformation_ctx = "datasource0")

df0 = Relationalize.apply(frame = datasource0, staging_path = glue_temp_storage, name = dfc_root_table_name, transformation_ctx = "dfc")

df1 = df0.select(dfc_root_table_name)

df2 = df1.toDF()

df2 = df1.select(explode(col('`request.data`')).alias("request_data"))

<then i write df1 to a PostgreSQL database which works fine>

我面临的问题:

“Relationalize”函数运行良好,但 request.data 字段变为 bigint,因此“explode”不起作用。

由于数据的结构,如果不首先在 JSON 上使用“Relationalize”,就无法完成爆炸。具体错误是:“org.apache.spark.sql.AnalysisException:无法解析'explode(request.data)' 由于数据类型不匹配:函数explode的输入应该是数组或映射类型,而不是bigint”

如果我尝试首先将动态帧设为数据帧,则会出现以下问题:“py4j.protocol.Py4JJavaError:调用 o72.jdbc 时发生错误。 :java.lang.IllegalArgumentException:无法获取结构的 JDBC 类型...”

我还尝试上传一个分类器,以便数据在爬行本身中变平,但 AWS 确认这行不通。

原始文件的 JSON 格式如下,我试图对其进行标准化:

- field1
- field2
- {}
  - field3
  - {}
    - field4
    - field5
  - []
    - {}
      - field6
      - {}
        - field7
        - field8
        - {}
          - field9
          - {}
            - field10

# Flatten nested df  
def flatten_df(nested_df): 
    for col in nested_df.columns:


    array_cols = [c[0] for c in nested_df.dtypes if c[1][:5] == 'array']
    for col in array_cols:
        nested_df =nested_df.withColumn(col, F.explode_outer(nested_df[col]))

    nested_cols = [c[0] for c in nested_df.dtypes if c[1][:6] == 'struct']
    if len(nested_cols) == 0:
        return nested_df

    flat_cols = [c[0] for c in nested_df.dtypes if c[1][:6] != 'struct']

    flat_df = nested_df.select(flat_cols +
                            [F.col(nc+'.'+c).alias(nc+'_'+c)
                                for nc in nested_cols
                                for c in nested_df.select(nc+'.*').columns])

    return flatten_df(flat_df)

df=flatten_df(df)

它将用下划线替换所有点。请注意,它使用explode_outer并不是explode在数组本身为空的情况下包含空值。此功能可用于spark v2.4+ only.

另请记住,爆炸数组将添加更多重复项,并且总体行大小将增加。扁平化结构会增加列的大小。简而言之,你原来的df会水平和垂直爆炸。它可能会减慢稍后处理数据的速度。

因此,我的建议是识别与功能相关的数据,并仅将这些数据存储在 postgresql 中,并将原始 json 文件存储在 s3 中。

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