通过 try() 之类的方法使 R 命令超时

2024-03-16

我正在并行运行大量迭代。某些迭代比其他迭代花费的时间要长得多(例如 100 倍)。我想将这些超时,但我不想深入研究函数(称为 fun.c)背后的 C 代码来完成繁重的工作。我希望有类似于 try() 的东西,但有一个 time.out 选项。然后我可以做类似的事情:

for (i in 1:1000) {
    try(fun.c(args),time.out=60))->to.return[i]
}

因此,如果 fun.c 在某个迭代中花费的时间超过 60 秒,那么修改后的 try() 函数就会终止它并返回警告或类似的内容。

有人有什么建议吗?提前致谢。


请参阅此线程:http://r.789695.n4.nabble.com/Time-out-for-a-R-Function-td3075686.html http://r.789695.n4.nabble.com/Time-out-for-a-R-Function-td3075686.html

and ?evalWithTimeout in the R.utils包裹。

这是一个例子:

require(R.utils)

## function that can take a long time
fn1 <- function(x)
{
    for (i in 1:x^x)
    {
        rep(x, 1000)
    }
    return("finished")
}

## test timeout
evalWithTimeout(fn1(3), timeout = 1, onTimeout = "error") # should be fine
evalWithTimeout(fn1(8), timeout = 1, onTimeout = "error") # should timeout
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