GetMethod 不区分大小写？

foreach(var filter in filters)
{
    var filterType = typeof(Filters);
    var method = filterType.GetMethod(filter);
    if (method != null) value = (string)method.Invoke(null, new[] { value });
}

有没有不区分大小写的方法来获取方法？

是的，使用 BindingFlags.IgnoreCase：

var method = filterType.GetMethod(filter, 
    BindingFlags.IgnoreCase | BindingFlags.Public | BindingFlags.Instance);

当心可能的歧义，你会得到一个 AmbigeousMatchException。