如何在R中处理hdf5文件？

我有一个文件在hdf5格式。我知道它应该是一个矩阵，但我想在其中读取该矩阵R这样我就可以研究它。我看到有一个h5r包应该有助于解决这个问题，但我没有看到任何简单易读/理解的教程。网上有这样的教程吗？具体来说，你如何阅读hdf5这个包的对象，以及如何实际提取矩阵？

UPDATE

我发现了一个包裹rhdf5它不是 CRAN 的一部分，而是 BioConductoR 的一部分。界面相对更容易理解，文档和示例代码也很清晰。我可以毫无问题地使用它。我的问题似乎是输入文件。我想要读取的矩阵实际上存储在hdf5文件为python pickle。所以每次我尝试打开它并通过R我有一个segmentation fault。我确实弄清楚了如何从内部保存矩阵python as a tsv文件，现在问题已经解决了。

The rhdf5包工作得很好，尽管它不在 CRAN 中。从安装它生物导体 http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/rhdf5.html

# as of 2020-09-08, these are the updated instructions per
# https://bioconductor.org/install/

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("rhdf5")

并使用它：

library(rhdf5)

列出文件中的对象以查找要读取的数据组：

h5ls("path/to/file.h5")

读取HDF5数据：

mydata <- h5read("path/to/file.h5", "/mygroup/mydata")

And 检查结构 http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/utils/html/str.html:

str(mydata)

（注意多维数组可能会出现转置 https://stackoverflow.com/questions/18359783/r-hdf5-dataset-written-incorrectly）。您还可以读取组，这些组将在 R 中命名为列表。