如何在 R 中将多个文件 read.table() 放入单个表中?

2024-04-09

我有名为<InputData>.<TestName>.csv我想为每个测试制作图表。我认为执行此操作的最佳方法是为每个 TestName 创建一个 R 表。每个测试都会生成相同的数据列,因此我想将每个测试的所有数据提取到 R 数据表中,并为输入数据添加一个额外的列。

我想做:

read.tables(c("B217.SE.csv", "C10.SE.csv"), sep=",")

产生(例如):

       Filename  col1   col2
1   B217.SE.csv     1      2
2   B217.SE.csv     2      4
3   C10.SE.csv      3      1
4   C10.SE.csv      4      5

这样做的正确方法是什么?一些我不知道的现有功能?使用for循环用R语言写出来?


我无法在您的数据上测试它,但您会想要使用apply像这样输入函数:

data <- do.call("rbind", lapply(c("file1", "file2"), function(fn) 
           data.frame(Filename=fn, read.csv(fn)
))

或者,您可以通过使用来简化它plyr。这是其工作方式的粗略模拟(使用数据帧而不是文件):

> df1 <- data.frame(c1=1:5, c2=rnorm(5))
> df2 <- data.frame(c1=3:7, c2=rnorm(5))

在这种情况下我将使用get代替read.csv:

> data <- ldply(c("df1", "df2"), function(dn) data.frame(Filename=dn, get(dn)))
> data
  Filename c1          c2
1  df1  1 -0.15679732
2  df1  2 -0.19392102
3  df1  3  0.01369413
4  df1  4 -0.73942829
5  df1  5 -1.27522427
6  df2  3 -0.33944114
7  df2  4 -0.12509065
8  df2  5  0.11225053
9  df2  6  0.88460684
10 df2  7 -0.70710520

Edit

采纳 Marek 的建议,您可以覆盖或创建自己的函数:

read.tables <- function(file.names, ...) {
    require(plyr)
    ldply(file.names, function(fn) data.frame(Filename=fn, read.csv(fn, ...)))
}

data <- read.tables(c("filename1.csv", "filename2.csv"))
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