将 R 函数封装在 python 中

2024-04-09

我想包装 princurve 包中包含的 R 函数。 使用 ipython,我使用 ipython cell R magic 成功完成了此操作:

%%R -i X -o s,lambda
fit1<-principal.curve(X)
s <- fit1$s
l <- fit1$lambda

但我想要一个可以从模块导入的函数,例如:

from mymodule import principal_curve
s, l = principal_curve(X)

我想我必须直接使用 rpy,我不知道如何......


我不使用 R,但在docs http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-dev/html/robjects_rpackages.html#importing-arbitrary-r-code-as-a-package您可以定义一个函数并将其导入到 python 模块中:

r_mod.py

from rpy2.robjects.packages import SignatureTranslatedAnonymousPackage

string = """
square <- function(x) {
    return(x^2)
}

cube <- function(x) {
    return(x^3)
}
"""

powerpack = SignatureTranslatedAnonymousPackage(string, "powerpack")

py_mod.py

from r_mod import powerpack

print powerpack.square(3)
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