使用插入符包通过controls = cforest_unbiased()运行cforest

2024-04-29

我想使用插入符包运行一个公正的 cforest 。这可能吗?

tc <- trainControl(method="cv",
               number=f,
               index=indexList,
               savePredictions=T,
               classProbs = TRUE,
               summaryFunction = twoClassSummary)
createCfGrid <- function(len, data) {
    g = createGrid("cforest", len, data)
    g = expand.grid(.controls = cforest_unbiased(mtry = 5, ntree = 1000))
    return(g)
}
set.seed(1)
(cfMatFit <- train(as.factor(f1win) ~ .,
                   data=df,
                   method="cforest",
                   metric="ROC",
                   trControl=tc,
                   tuneGrid = createCfGrid))

错误是Error in as.character.default(<S4 object of class "ForestControl">) : no method for coercing this S4 class to a vector

这是因为 cforest_control() 无法强制转换为数据帧。如果我使用以下函数,该函数确实可以工作:

...
g = expand.grid(.mtry = 5)
...

但是,如果我想更改 ntree,这没有效果:

...
g = expand.grid(.mtry = 5, .ntree = 1000)
...

这不会像 randomForest 那样出错。


网格应该是一个简单的数据框,其中有一列称为.mtry。代码

 g = createGrid("cforest", len, data)

将为您生成它。如果你想指定ntree你只需通过一个controls对象作为另一个参数train但忽略mtry:

 mod <- train(Species ~ ., data = iris,
              method = "cforest",
              controls = cforest_unbiased(ntree = 10))

caret照顾改变mtry为你。

Max

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