glmnet 未从 cv.glmnet 收敛 lambda.min

2024-06-20

我跑了20倍cv.glmnet套索模型以获得 lambda 的“最佳”值。但是,当我尝试重现结果时glmnet(),我收到一个错误,内容如下:

Warning messages:
1: from glmnet Fortran code (error code -1); Convergence for 1th lambda
   value not reached after maxit=100000 iterations; solutions for larger 
   lambdas returned 
2: In getcoef(fit, nvars, nx, vnames) :
   an empty model has been returned; probably a convergence issue

我的代码是这样写的:

set.seed(5)
cv.out <- cv.glmnet(x[train,],y[train],family="binomial",nfolds=20,alpha=1,parallel=TRUE)
coef(cv.out)
bestlam <- cv.out$lambda.min
lasso.mod.best <- glmnet(x[train,],y[train],alpha=1,family="binomial",lambda=bestlam)

现在,价值bestlam上面是2.976023e-05所以也许这就是造成问题的原因?这是 lambda 值的舍入问题吗?有什么原因导致我无法直接从glmnet()功能?如果我使用与该值相似范围内的 lambda 值向量bestlam,我没有任何问题。


你将一个 lambda 传递给你的glmnet (lambda=bestlab)这是一个很大的禁忌(您正在尝试仅使用一个 lambda 值来训练模型)。

来自glmnet文档(?glmnet):

lambda: A user supplied lambda sequence. Typical usage is to have the 
program compute its own lambda sequence based on nlambda and 
lambda.min.ratio. Supplying a value of lambda overrides this. WARNING: use 
with care. Do not supply a single value for lambda (for predictions after CV 
use predict() instead). Supply instead a decreasing sequence of lambda 
values. glmnet relies on its warms starts for speed, and its often faster to 
fit a whole path than compute a single fit.
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