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核磁数据处理之: FSL数据快视

2023-05-16

数据质量检查的时候, 惯用的做法是用fsleyes逐个打开检查, 当数据量变大的时候, 这个做法非常消耗时间和精力. 考虑到NifTI数据本质上就是好多成像切片三维重建的, 如果可以将其中一些切片拿出来在html中批量显示, 一个NifTI文件对应一排切片图像, 这样就可以到达快速检查的目的. 好在FSL已经提供了这样的功能, 只需要组合两个FSL命令: slicesdir 和imglob. 

slicesdir `imglob *`

如果只查看当前文件夹下以特定名称开头的NifTI文件. 以pat开头为例:

slicesdir `imglob pat*`

imglog选择切片, slicesdir生成数据快视html.
这里写图片描述

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fsl

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数据快视

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