并行算法解决list

2023-11-11

并行算法序列和字符串:

·Scan (prefix sums)

·List ranking

·Sorting

·Merging

·Medians

·Searching

·String matching

·Other string operations

并行算法的树和图:

·Trees

·Connected components

·Spanning trees

·Shortest paths

·Maximal independent set

·Graph separators

计算几何的并行算法:

·Convex hull

·Closest pairs

·Delaunay triangulation

数值/科学计算的并行算法

·Fourier transform

·Dense matrix operations

·Sparse matrix operations

·N-body code

·Other

Scan

Scan操作(也称为all-prefix-sum)采用二元联合运算符作为标识函数和arry,并返回一个新数组,其中每个元素具有所有先前元素的总和(sum是相对于关联运算符定义的)。例如

scan(+, 0, [2, 8, 9, -4, 1, 3, -2, 7]);

[0, 2, 10, 19, 15, 16, 19, 17]

算法

·Tree Scan

List Ranking

List ranking需要一个链接列表,并返回列表中每个元素的位置。位置给出了距列表尾部的距离。使用整数数组表示列表,其中每个整数表示列表中下一个元素的索引。我们用自指针终止列表。 例如,数组

[2, 5, 1, 3, 7, 6, 6, 3]

代表以下两列:

0 -> 2 -> 1 -> 5 -> 6

4 -> 7 -> 3

算法:

·Wyllie

·Random Mate

·Sorting

有许多并行排序算法。这里给出了一些示例。

算法

·Quicksort

·Selection sort

·Insertion sort

·Counting sort

·Batcher’s Bitonic Sort

·Radix Sort

·String Radix Sort

Merging算法:

·Batcher’s Odd-Even Merge

·Halving Merge

Medians

这里考虑找到一个集合中第k个最小元素的问题。众所周知,这个问题可以在O(n)时间序列内解决。在这里考虑的两个算法都需要O(n)的工作,虽然第一个是预期的情况,第二个是高概率。

算法

·Quick Select

·Sample Select

Searching算法:

·Hash Tables

String Matching

字符串匹配问题需要一个TEXT字符串和一个PATTERN字符串,并查找模式在文本中出现的所有位置。

算法:

·Naive algorithm

·Vishkin algorithm

其他字符串

这里考虑字符串的各种操作,比如按字母顺序比较两个字符串,将一串字符分解成几行,然后再匹配括号。

算法

·String comparison

·breaking a string into lines

·Matching Parentheses

树算法:

·Generate Euler tour from edgelist

·Rootfix (e.g. for level numbering)

·Leaffix (e.g. for subtree sizes)

连接组件

连接组件问题采用无向图,并返回所有通过边连接的组件。对于一个有n个顶点和m条边的图,这个问题可以用O(n + m)时间顺序地使用深度优先搜索或宽度优先搜索来解决,并行算法是基于收缩图的思想。

算法

·Awerbuch Shiloach

·Random mate

·Hybrid

生成树

生成树算法与连接组件类似,但生成树算法需要跟踪哪些边用于收缩,而不需要将图扩展回去。

算法

·Hybrid based Spanning Tree

短路径算法:

·Breadth First Search

最大独立集算法:

·Luby’s Algorithm

图划分算法:

·Spectral

·Recursive bisection

·Teng/Vavasis/Miller

Convex Hull算法:

·Jarvis March

·Quickhull

·Kirkpatrick-Seidel

·Overmar’s Mergehull

·Atallah’s variant of Overmar’s Mergehull (O(lg n) time)

Closest Pairs算法:

·All closest pairs

Delaunay Triangulation算法:

·Projection based

·Closest pair based

Fourier Transform算法:

·Fast Fourier transform

Dense Matrix Operations算法:

·Matrix multiply

·Matrix inverse

·Linear system solve

·Null space of matrix

Sparse Matrix Operations算法:

·Matrix-vector multiply

·Jacobi

·Conjugate gradient

N-body Code算法:

·All pairs

·Barnes-Hut

·Greengard’s FMM

·PMTA (a hybrid)

其他数值编码算法:

·prime numbers

·adaptive integration

·line fitting

·order-m recurrences

·Tree based preconditioner

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