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windows10安装RDKit化学信息学python库（通过anaconda）

2023-11-18

RDKit是一款功能强大的化学信息学工具

推荐使用anaconda安装，安装时应当参考

1.官方安装指南

Rdkit :: Anaconda.org

2.中文教程

RDKit简介 — RDKit 中文教程 2020.09 文档 (chenzhaoqiang.com)

安装anaconda

首先安装anaconda,这一步可以参考中文文档或者任意安装教程

在anaconda 官网 <Anaconda | Individual Edition>下载对应操作系统的anaconda，对于window10应该下载对应的win 64位版本，一般下首页这个就可，这个会根据不同系统来显示

 安装anaconda的步骤相关资料有很多，这里不再赘述，建议不要下在系统盘，比较占空间

下载完成后可以打开anaconda promt

 ps:我这里用的是python3.6，不同版本的python有可能有影响，如果不方便用3.6也可以试试

安装rdkit

打开anaconda prompt

可以直接装在base也可以新建一个env

这里我直接装的base

conda install -c conda-forge rdkit

 这样就装好了，不同人的环境有差异，这里需要下的依赖包不一定是一样的，（我这之前装过pytorch了，跟装rdkit莫有关系）

 在jupyter notebook试一哈

 检查一下，莫得问题

 踩的坑

1.在pycharm里面不能直接装，会搜不到库

2.如果按中文教程里面的命令

conda install -c rdkit rdkit

会报错

 from .rdBase import rdkitVersion as __version__ 错误

果然还得看原文档，写的很清晰简单

 祝小伙伴们安装成功

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生信之路

python

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