一、
Endnote， Mendeley， Zotero，NoteExpress 和 NoteFirst，这些文献管理软件从功能上各有特色，网上的评论文章也不少，我自己的的使用体验
如下： A. 功能方面： 在导入中文文献数据的准确性上， Endnote， Zotero和Mendeley都出现不同程度的问题，对中文期刊参考文献格式不能很好的支持并且对国标也不能正确理解。这三款是国外软件，主要针对英文作者，因此没有重点解决中文期刊作者的问题也是可以理解的。人家没把咱列为主要目标客户嘛，呵呵。但是值得一提的是Mendeley内置的PDF浏览器，可以直接收录英文的PDF文件，这一个功能很强大， 我很喜欢。 Zotero只支持Firefox浏览器，对于我们经常用IE的人不适合。 国内的软件NoteExpress和NoteFirst做的都不错，可以很好的支持中文文献，但NE在对国标的细节处理上依旧存在问题， 比如无法自动区别英文文献中的作者是中文作者的汉语拼音， 也不支持中英文双语的参考文献自动形成。 而NoteFirst 推出的相对比较晚，所提供的期刊样式还有待完善， 但它全面支持国标并且支持双语参考文献自动形成比较适用中文科技期刊的作者，这对我这个经常需要投被EI收录期刊的人来说是非常实用的。B. 设计结构方面： Endnote（Web）,Zotero，Mendeley 和NoteFirst是网络版的设计，而reference manager, NoteExpress 以及国内的另一款软件医学文献王都只有单机版。 网络版软件的好处就是能够使用户在不同地点、不同电脑上均可以同步自己最新的个人数据库。
我相信随着互联网的飞速发展，网络版一定会成为主流产品。 而上面提到的这几款网络版软件中前两种都没有设计客户端， 在中国目前网络发展尚不完善的情况下纯粹网络版的产品可能会有问题，而只有Mendeley和NoteFirst具有网络版和单机使用的共同设计。C. 价格方面：Endnote和Noteexpress均是收费的软件， Endnote还价格不菲， 只有机构用户才会使用。而Mendeley， Zotero和NoteFirst都提供免费版本。 功能上对于我这样的科技期刊作者来说已经足够用了。 当然，要写大论文的博士生们，还是用掏点钱使用软件的高级功能吧。基于以上原因， 我最终选择了Mendeley和Notefirst 共同使用， NoteFirst 进行文献收集管理和论文写作， Mendeley进行PDF文件的管理。这是我的个人使用经验之谈，谨供大家参考。
二、
文献管理的方便性：
1. 建立目录：要管理的文献不上千也上百了，建立目录分门别类才好。这方面 Endnote 不 建立目录： 行，只能新建文件(Library)，没有分目录的功能。Biblioscape 支持目录功能。
2. 搜索 搜索：EndNote 和 Biblioscape 区别不大，都支持题目、作者、关键字等搜索功能。
3.排序 排序：没想到 EndNote 在这么简单的功能上栽了跟头。按照年份排序是对的，按照 Title 排序居然是乱的。
4.连接文件 连接文件：EndNote 和 Biblioscape 都具备把一个文献条目链接一个文件的功能。这样在 浏览文献时就可以方便地打开全文了。
5.查找相同 查找相同：EndNote 和 Biblioscape 都具有查找相同文献的功能。
6.交叉引用 也就是一篇文献引用另一篇文献。 交叉引用： EndNote 不支持交叉引用关系。 Biblioscape 很好，可以在文献之间建立很多关系：引用、同作者等。
7.同步与云存储 同步即在不同的电脑上管理，访问同一个文献数据库，同时也可以将数据库储存在云服务器上提供更安全和稳定的数据库。
三。
来自罗绍峰
文献管理软件概述
中国科学技术大学 罗昭锋 2011/03/14
一、时代背景
文献管理软件的诞生也是社会需求的产物。很多整天与文献打交道的人被文献郁闷了，然后就有了专门的文献管理软件。整天与文献打交道最多的无非是科研工作者，还有一类图书馆员以及文献发行者，不过后一类人群是少数。此处主要讨论科研工作者。
二、科研与文献的那点关系
孙武说，要知己知彼，才能百战不殆。牛顿说，我是站在巨人肩膀上的。所以，科研工作者开始知彼之路，寻找巨人的肩膀。第一步，就是要找到需要的文献，在次不多论述，因为讲文献检索的多如牛毛。找到之后能咋样？读呗！吭哧吭哧，读啊读，很多文献都是坑爹的，删！吭哧吭哧，继续读…… 终于有篇重要的文献。保存，建文件夹。哇噻，突然灵光一闪，思如泉涌，赶紧记下来，打开word，记下自己的一闪灵光。吭哧吭哧，生活继续，读得文献越来越多的，电脑已经建了很多文件夹。再读文献，经常碰到新的问题，这篇文献好像见过。翻出google强大的桌面搜索，一找果然看过。当时有记录么？岁月流逝，文献越来越多，渐渐记不清看过什么了，记不得看过的文献在哪儿了。要写文章的时候，找不到文献了，只好再重新下一遍。好不容易，写了一篇洋洋洒洒的论文，投稿前发现第五篇参考文献后面少引了一篇重要文献。崩溃，重新调整引文序号，然来的6变成7，8变9.……………………35变成36，终于完成了……
这估计目前大多数人与文献打交道的方式，基本算是原始社会的水平了。其实，一切可以更简单。
三、文献管理软件的一些基本功能
1、可以直接联网到不同的数据库进行检索，免去我们登录不同数据库的劳累之苦，并且提高了效率；
2、可以非常方便地管理文献信息，包括文摘、全文、笔记、以及其它的附件材料等等；省去我们建立一个有一个的文件夹；检索功能大大方便我们查找到需要的文献；多数软件还具备一定的分析功能；
3、文末参考文献格式的编辑；这个是体力活，不过使用软件就会轻松了许多。
四、学习文献管理软件的思路
上面讲到文献管理软件的基本功能之后，我们知道，这些软件无非是帮助我们更高效地管理文献。所以学习的思路，首先要弄明白怎么将文献交给软件管理，其实就是在软件中建立数据库的过程。当使用软件建立了数据库之后，我们就要知道，软件提供哪些管理功能，可以提高我们的工作效率。如果你需要写论文，还需要知道如何编辑参考文献格式。
以上是学习的基本思路，但不同的软件，操作上略有不同。针对具体软件，将在以后的博文中予以介绍。下面概要性介绍一下目前市面上的文献管理软件。
五、文献管理软件的分类及资源
关于文献管理软件的分类，未见专门的论述。个人认为可以有很多种分法。譬如，有免费的和收费的；有开源的和不开源的；有在线的和离线的，有跨平台的和不跨平台的，其中不跨平台的可能会有多种平台的版本软件。
1）、先说说国产的文献管理软件
国产的基本只有四家，分别是noteexpress，notefirst，医学文献王和新科学。
NoteExpress应该算是国产软件中的精品了，功能齐全，设计理念先进，有很多功能优于老牌的劲旅Endnote。适合国人习惯，很容易上手。稳定性和设计细节还需进一步改进。推荐！有北京爱琴海公司开发，网址 www.reflib.org 或http://www.scinote.com/ 最新版本: 2.6.1482 。
Notefirst是基于Science2.0的理念，倡导共享与协作。结合了客户端和在线管理的优势，集成了文件管理，文献收集，论文中参考文献的自动形成，参考文献自动校对等功能。支持多种其他软件的文件格式，并集成了多语言系统。详细可以参考公司网站http://www.notefirst.com/，以及百度百科的词条 http://baike.baidu.com/view/3758548.htm。它由西安知先信息技术有限公司开发并提供技术支持，用户可免费下载，基本功能使用免费，但高级功能需要购买开通。目前最新版本 版本：V1.4.1 2010.12.21 。
医学文献王，针对医学领域的专业化文献管理工具。由北京金叶天翔科技有限公司开发，网址，http://www.medscape.com.cn/，为找到免费试用版，未进行测试。想了解可以到公司网站查看。
新科学是基于网络的文献管理与分享平台，理念是以文会友。不错的尝试，由几位热血青年创立。网址www.xinkexue.com。
2）、国外的老牌单机版软件
知名度最高的要数Endnote了，每年更新一版，每次都有一些功能上的改进。是目前使用面最广，认可度最高的文献管理软件。网上可以找到很多教程。包括本人07年写的《文献管理与文献信息分析》电子手册，2009年录制的“EndnoteX3系列视频教程”等。网址www.endnote.com，软件现在属于汤森路透公司。同属该公司的还有reference manager和procite两款知名的文献管理软件。不过，出于商业上的需要，后两款软件被收编之后，更新较少。公司主要的精力放在了endnote上。
Quosa国内关注不多，也是一款比较有个性的软件。最早提供自动下载PDF全文（你要有权限）、能够追踪最新文献、目录可导入Endnote、能进行全文文献分析等功能。值得尝试，资源目前主要局限于生命科学领域。网站：http://www.quosa.com/
还有一款软件叫Biblioscape，公司网址http://www.biblioscape.com/，不过公司网站最后的更新到2009年5月6日，不知道为何近期没有更新。从公司主页介绍看节目类似noteexpress的目录导航，内置pdf浏览器，功能上未见特别出彩的地方。未使用过。
3）、国外免费的单机版软件
Jabref是免费的跨平台文献管理软件。适用于Windows, Linux 和Mac OS X系统。JabRef 最大的特点就是使用 BibTeX 格式的数据库，所以它最适合 LaTeX 用户使用。网址 http://jabref.sourceforge.net/
Bibus（windows下推荐）：和Endnote功能差不多，支持在Word及OpenOffice中插入文献，自动生成参考文献目录。支持文献分组。使用MySQL或SQLite（任选其一）数据库储存参考文献数据。它能在 OpenOffice及MS Word中直接插入引文，而无需在Word中安装宏，或插件什么的。并自动生成参考文献目录。其功能目前已与商业软件Endnote，RM接近，支持 Unicode，支持中文。网址http://bibus-biblio.sourceforge.net
4）、国外的在线文献管理软件
Mendeley既有客户端，又支持在线管理，与notefirst类似。免费，可以自动导入pdf文献是它的特色。用来管理pdf文件也是不错的主意。同时它还引入了社会化功能，可以实现以文会友的功能。网址www.mendeley.com 。
Zotero算是比较独特的了，它只是一个firefox的插件，可以在线收集文献信息，并通过插件的形式进行管理。www.zotero.org 公司网站上有详细的中文介绍，不妨看一下 http://www.zotero.org/support/zh/quick_start_guide
Endnote Web是endnote的网络版，可以与桌面端同步数据，除了WOS的强大数据源之外，EndnoteWeb与其它在线软件相比没有多少优势。管理较强，缺少互动。
除此之外，还有几家大型数据库上开发的在线文献管理工具，不过流传并不广泛。有兴趣者可以了解一下。分别是：
citeulike 是由springer集团开发的在线文献管理与分享平台。可以便捷存储网上的文献，最新还加入了文献自动推荐功能，可以与同事分享文章，也可以知道哪些人在读相同的文章，也可以保存和搜索PDF文件等。http://www.citeulike.org/。
Connotea，这是Nature出版集团旗下网站。借鉴当前流行的delicious等社会书签的创意，专注于科研领域，并可导入桌面文献管理软件的数据，是当前比较流行的一款在线文献管理工具。 网址：http://www.connotea.org/ 中文介绍可以参考
http://ncwf75.blog.163.com/blog/static/1144020092010829101435777/
2collab 是Elsevier 出版集团旗下网站。 2collab提供了一种可处理来自各种不同资源的学术信息的新方式，研究人员在这样一个平台上可以同其所在领域的同行进行沟通交流，进而一起探索、分享信息和相互协作。 网址：http://www.2collab.com
以上包括了所有我目前所知道的文献管理软件和在线的文献管理平台。仅作了简单介绍，本博今后也会对部分软件进行介绍和培训，
欢迎关注。至于本文的不妥之处，敬请指出。（文摘引用了网上几段文字，未一一标出）
