将 numpy 数组保存到 csv 会产生 TypeError Mismatch

我有一个 numpy 数组，其中包含以下形式的数字数据：

example = numpy.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for k in range(0, 10)])

所以它是 10 组的数组，其中每组由 2 个长度相等的列表组成，并且仅包含数字。 运行以下保存代码会出现以下错误：

numpy.savetxt('exampleData.csv', test, delimiter=',')
TypeError: Mismatch between array dtype ('int32') and format specifier ('%.18e %.18e')

我猜想这可以通过 fmt='xyz' 参数中的某些内容来解决，但文档并不是特别清楚。任何帮助，将不胜感激。

（在我的实际数据中， i 和 j 列表是长浮点数列表，例如 '0.0047322940571' 等）

Your example是一个 3d 数组

In [82]: example=np.array([[[i for i in range(0, 5)],[0 for j in range(0, 5)]] for  k in range(0, 3)])  # chg 10 to 3 for display

In [83]: example.shape
Out[83]: (3L, 2L, 5L)

In [84]: example
Out[84]: 
array([[[0, 1, 2, 3, 4],
        [0, 0, 0, 0, 0]],

       [[0, 1, 2, 3, 4],
        [0, 0, 0, 0, 0]],

       [[0, 1, 2, 3, 4],
        [0, 0, 0, 0, 0]]])

尝试保存整个内容会导致错误（由于版本不同而有不同的消息）：

In [87]: np.savetxt('test.csv',example, delimiter=',')
....
TypeError: float argument required, not numpy.ndarray 

但保存一“行”就可以了

In [88]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',')

以整数格式保存可以使输出更漂亮

In [94]: np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%d')

In [95]: with open('test.csv') as f:print f.read()
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0

那么你希望如何保存 3d 数组呢？请记住您将如何使用它/阅读它。多个文件？一个文件内有多个块？

https://stackoverflow.com/a/3685339/901925是一个关于如何保存 3d 数组的 6 年前的答案。简单的答案是打开一个文件，然后执行多个savetxt对于数组的切片。这将数据保存在块中。但是加载这些块是另一个SO问题（之前已经出现过）。

In [100]: with open('test.csv','w') as f:
     ...:     for row in example:
     ...:         np.savetxt(f,row,delimiter=',',fmt='%d',footer='====')
     ...:         

In [101]: with open('test.csv') as f:print f.read()
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====
0,1,2,3,4
0,0,0,0,0
# ====

为了回应你的评论，这有效

example=np.ones((4,2,100))
np.savetxt('test.csv',example[1,...], delimiter=',',fmt='%.18e')

保存 3d 数组的另一种方法是将其重塑为 2d。加载后，您可以将其重新整形回 3D，可能使用您存储在注释行中的信息

np.savetxt('test.csv',example.reshape(-1,example.shape[-1]), delimiter=',',fmt='%.18e')