我有一个物种出现的数据集，我试图通过制作凸包将其转换为出现的区域。我可以手动执行此操作（即一次一个物种），但我真的很希望能够通过物种名称自动处理它。
可以在此处找到精简的示例数据集：https://pastebin.com/dWxEvyUB
这是我目前手动执行的方法：
library(tidyverse)
library(sf)
library(rgeos)
library(maps)
library(mapview)
library(mapdata)
library(ggplot2)
fd <- read_csv("occurrence.csv")
spA.dist <- fd %>%
filter(species == "sp.A") %>%
dplyr::select(lon,lat) %>%
as.matrix() %>%
coords2Polygons(ID="distribution") %>%
gConvexHull() %>%
gBuffer()
spB.dist <- fd %>%
filter(species == "sp.B") %>%
dplyr::select(lon,lat) %>%
as.matrix() %>%
coords2Polygons(ID="distribution") %>%
gConvexHull() %>%
gBuffer()
wrld2 = st_as_sf(map('world2', plot=F, fill=T))
ggplot() +
geom_sf(data=wrld2, fill='gray20',color="lightgrey",size=0.07) +
geom_polygon(aes(x=long,y=lat,group=group),color="red",data=spA.dist,fill=NA) +
geom_polygon(aes(x=long,y=lat,group=group),color="blue",data=spB.dist,fill=NA) +
coord_sf(xlim=c(100,300), ylim=c(-60,60))
这会根据观察结果的凸包显示两个物种出现区域的地图。我意识到我在这里混合了不同的空间库，所以如果可能的话，最好在 sf 中完成这一切。在我的真实数据中，我有两个以上的物种，我可以复制并粘贴每个物种的代码，但似乎应该可以简化这一点，以便多边形（以及后续的凸包）由因子级别构建自动地。更像这样的东西：
polys <- st_as_sf(fd) %>%
group_by(species) %>%
magically_make_polygons(lon,lat) %>%
st_convex_hull() %>%
st_buffer()
我已经搜索了好几天并挖掘了大量文档。很多空间方面的东西对我来说都是不直观的，所以我希望我缺少很多基本的理解。这可以做到吗？
这是一个可能的解决方案，使用tidyverse（实际上只是dplyr）和sf- 包（和mapview包以便快速查看）。
你非常接近你自己的解决方案（工藤的）。诀窍是summarise分组数据，然后创建船体..
library( tidyverse )
library( sf )
#create simple feature
df.sf <- df %>%
st_as_sf( coords = c( "lon", "lat" ), crs = 4326 )
#what are we working with?
# perform fast visual check using mapview-package
mapview::mapview( df.sf )
#group and summarise by species, and draw hulls
hulls <- df.sf %>%
group_by( species ) %>%
summarise( geometry = st_combine( geometry ) ) %>%
st_convex_hull()
#result
mapview::mapview( list( df.sf, hulls ) )
