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“[<-.data.frame”中出现 R 错误...替换有 # 项，需要 #

2023-11-26

我是 R 新手，这超出了我的能力范围。下面的脚本使用两个虚拟表（结果和计数），每个表都有两列（A 和 B）。我正在运行排列测试来比较 A 和 B 的结果。具体来说，我正在查看 A 和 B 的结果/计数。结果和计数都有 20 行，并且我编写了一个循环来运行排列测试每行的前 10 行，然后是前 11 行，然后是 12 行，最多 20 行。当它起作用时（有时确实如此），我最后会得到一个漂亮的图表。

#Set up the dummy data - two competing tables (result & count)
result <- data.frame(matrix(runif(40)*100, nrow=20))
names(result)[1] <- paste("A"); names(result)[2] <- paste("B")
count <- data.frame(matrix(runif(40)*100, nrow=20))
names(count)[1] <- paste("A"); names(count)[2] <- paste("B")
n.iter <- 1e3

#Run a permutation test
permtest <- function(result, count) {
    n <- dim(result)[1]
#   print(n)
    stat <- function(x, y) abs(diff(range(colSums(x)/colSums(y))))
    swap <- function(x, i) { x[i, ] <- cbind(x[, "B"], x[, "A"])[i, ]; return (x) }
    sim <- replicate(n.iter, { i <- runif(n) < 1/2; stat(swap(result, i), swap(count, i)) })
    result.stat <- stat(result, count)
    p.value <- sum(sim >= result.stat) / length(sim)
    return(list(sim, result.stat, p.value))
}

#Compute evolution of p-values over time
p.evol <- data.frame()
for (i in 10:dim(result)[1]) {
#   print(i)
    permresults <- permtest(result[1:i,], count[1:i,])
    p.value <- permresults[[3]]
    p.evol <- rbind(p.evol, c(i, p.value, 1-p.value))
}
colnames(p.evol) <- c("day", "p.value", "conf")
dev.new()
plot(p.evol[,1],p.evol[,3], type="b", xlab="Day",ylab="Percentage", main="Evolution of Confidence")

问题是，虽然有时运行没有问题，但大多数时候我都会遇到Error in '[<-.data.frame'('*tmp*', i, , value = numeric(0)) : replacement has 0 items, need 24. With options(error=traceback)我在这里得到输出，但我不明白：

f(ngettext(m, "replacement has %d item, need %d", 
        "replacement has %d items, need %d"), m, n * p), domain = NA)
16: `[<-.data.frame`(`*tmp*`, i, , value = numeric(0)) at errortest.R#16
15: `[<-`(`*tmp*`, i, , value = numeric(0)) at errortest.R#16
14: swap(result, i)
13: is.data.frame(x)
12: colSums(x)
11: diff(range(colSums(x)/colSums(y))) at errortest.R#15
10: stat(swap(result, i), swap(count, i)) at errortest.R#17
9: FUN(c(0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
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   0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L)[[42L]], ...)
8: lapply(X = X, FUN = FUN, ...)
7: sapply(integer(n), eval.parent(substitute(function(...) expr)), 
       simplify = simplify)
6: replicate(n.iter, {
       i <- runif(n) < 1/2
       stat(swap(result, i), swap(count, i))
   }) at errortest.R#17
5: permtest(result[1:i, ], count[1:i, ]) at errortest.R#27
4: eval(expr, envir, enclos)
3: eval(ei, envir)
2: withVisible(eval(ei, envir))
1: source("errortest.R", echo = F)

特别令人费解的是它的作用有时！这怎么可能？我还注意到，当我取消评论时print(n) and print(i)它似乎使它更频繁地工作，尽管当它们没有被注释时它可能会失败，而当它们被注释时它可能会工作。先谢谢您的帮助！


当你不走运并且i <- runif(n) < 1/2仅由FALSE，即没有发生任何排列。您需要添加一个检查swap函数来解决这个问题。

本文内容由网友自发贡献，版权归原作者所有，本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容，请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

r

DataFrame

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