model.frame.default 中的错误：变量长度不同

在使用 mgcv 包运行 gam 模型时，我遇到了一条我无法理解的奇怪错误消息：

“model.frame.default(formula = Death ~ pm10 + Lag(resid1, 1) + 中的错误：变量长度不同（发现“Lag(resid1, 1)”）”。

model1中使用的观测值数量与偏差残差的长度完全相同，因此我认为这个错误与数据大小或长度的差异无关。

我在网上发现了一个相当相关的错误消息here，但是该帖子没有得到足够的答案，所以它对我的问题没有帮助。

可重现的示例和数据如下：

library(quantmod)
library(mgcv) 
require(dlnm)

df <- chicagoNMMAPS
df1 <- df[,c("date","dow","death","temp","pm10")] 
df1$trend<-seq(dim(df1)[1]) ### Create a time trend

运行模型

model1<-gam(death ~ pm10 + s(trend,k=14*7)+ s(temp,k=5),
data=df1, na.action=na.omit, family=poisson)

获取偏差残差

resid1 <- residuals(model1,type="deviance")

向模型 1 添加一日滞后偏差

model1_1 <- update(model1,.~.+ Lag(resid1,1),  na.action=na.omit)

model1_2<-gam(death ~ pm10 + s(trend,k=14*7)+ s(temp,k=5) + Lag(resid1,1), data=df1, 
na.action=na.omit, family=poisson)

这两种模型都产生相同的错误消息。

Joran 建议在运行模型之前先删除 NA。因此，我删除了 NA，运行模型并获得了残差。当我通过包含滞后残差更新 model2 时，错误消息不再出现。

删除 NA

df2<-df1[complete.cases(df1),]

运行主模型

model2<-gam(death ~ pm10 + s(trend,k=14*7)+ s(temp,k=5), data=df2, family=poisson)

获取残差

resid2 <- residuals(model2,type="deviance")

通过包含滞后 1 残差来更新模型 2

model2_1 <- update(model2,.~.+ Lag(resid2,1),  na.action=na.omit)