多处理另一个函数的函数

2023-12-19

我正在对模拟的时间序列进行分析。基本上,它为每个时间步骤执行相同的任务。由于时间步数非常多,并且每个时间步的分析都是独立的,因此我想创建一个可以多处理另一个函数的函数。后者将有参数,并返回结果。

使用共享字典和 lib并发.futures,我设法编写了以下内容:

import concurrent.futures as Cfut
def multiprocess_loop_grouped(function, param_list, group_size, Nworkers, *args):
    # function : function that is running in parallel
    # param_list : list of items
    # group_size : size of the groups
    # Nworkers : number of group/items running in the same time
    # **param_fixed : passing parameters

    manager = mlp.Manager()
    dic = manager.dict()
    executor = Cfut.ProcessPoolExecutor(Nworkers)

    futures = [executor.submit(function, param, dic, *args)
           for param in grouper(param_list, group_size)]

    Cfut.wait(futures)
    return [dic[i] for i in sorted(dic.keys())]

通常,我可以这样使用它:

def read_file(files, dictionnary):
    for file in files:
        i = int(file[4:9])
        #print(str(i))
        if 'bz2' in file:
            os.system('bunzip2 ' + file)
            file = file[:-4]
        dictionnary[i] = np.loadtxt(file)
        os.system('bzip2 ' + file)

Map = np.array(multiprocess_loop_grouped(read_file, list_alti, Group_size, N_thread))

或者像这样:

def autocorr(x):
    result = np.correlate(x, x, mode='full')
    return result[result.size//2:]

def find_lambda_finger(indexes, dic, Deviation):
    for i in indexes :
        #print(str(i))
        # Beach = Deviation[i,:] - np.mean(Deviation[i,:])
        dic[i] = Anls.find_first_max(autocorr(Deviation[i,:]), valmax = True)

args = [Deviation]
Temp = Rescal.multiprocess_loop_grouped(find_lambda_finger, range(Nalti), Group_size, N_thread, *args)

基本上,它正在发挥作用。但效果不佳。有时会崩溃。有时它实际上启动了与 Nworkers 数量相同的 python 进程,有时当我指定时,一次只有 2 或 3 个进程在运行Nworkers = 15.

例如,我遇到的一个经典错误在我提出的以下主题中进行了描述:在多处理之后调用 matplotlib 有时会导致错误:主线程不在主循环中 https://stackoverflow.com/questions/53045307/calling-matplotlib-after-multiprocessing-sometimes-results-in-error-main-threa

什么是更Pythonic的方式来实现我想要的?如何改进该功能的控制?如何控制更多正在运行的python进程的数量?


Python 多处理的基本概念之一是使用队列。当您有一个可以迭代且不需要由子流程更改的输入列表时,它的工作效果非常好。它还可以让您很好地控制所有进程,因为您可以生成所需的数量,可以空闲运行它们或停止它们。

调试起来也容易得多。显式共享数据通常是一种更难以正确设置的方法。

队列可以容纳任何东西,因为根据定义它们是可迭代的。因此,您可以用文件路径字符串填充它们以读取文件,用不可迭代的数字来进行计算,甚至用图像来绘制。

在您的情况下,布局可能如下所示:

import multiprocessing as mp
import numpy as np
import itertools as it


def worker1(in_queue, out_queue):
    #holds when nothing is available, stops when 'STOP' is seen
    for a in iter(in_queue.get, 'STOP'):
        #do something
        out_queue.put({a: result}) #return your result linked to the input

def worker2(in_queue, out_queue):
    for a in iter(in_queue.get, 'STOP'):
        #do something differently
        out_queue.put({a: result}) //return your result linked to the input

def multiprocess_loop_grouped(function, param_list, group_size, Nworkers, *args):
    # your final result
    result = {}

    in_queue = mp.Queue()
    out_queue = mp.Queue()

    # fill your input
    for a in param_list:
        in_queue.put(a)
    # stop command at end of input
    for n in range(Nworkers):
        in_queue.put('STOP')

    # setup your worker process doing task as specified
    process = [mp.Process(target=function,
               args=(in_queue, out_queue), daemon=True) for x in range(Nworkers)]

    # run processes
    for p in process:
        p.start()

    # wait for processes to finish
    for p in process:
        p.join()

    # collect your results from the calculations
    for a in param_list:
        result.update(out_queue.get())

    return result

temp = multiprocess_loop_grouped(worker1, param_list, group_size, Nworkers, *args)
map = multiprocess_loop_grouped(worker2, param_list, group_size, Nworkers, *args)

当您担心队列内存不足时,可以使其更加动态。您需要在进程运行时填充和清空队列。看这个例子here https://stackoverflow.com/a/42625054/4141279.

最后的话:它并不像您所要求的那样更加 Pythonic。但对于新手来说更容易理解;-)

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