R 中 MuMIn 包的标准化

2023-12-28

我使用 R 中的“MuMIn”包来选择模型并计算输入变量(rain、brk、onset、wid)的效应大小。为了使变量之间的效应大小具有可比性,我使用标准化函数对它们进行了标准化arm包裹。这是我正在遵循的代码:

供参考,请参阅本文附录:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1420-9101.2010.02210.x/full http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1420-9101.2010.02210.x/full格鲁伯等人。 2011:生态学和进化中的多模型推理:挑战和解决方案

data1<-read.csv("data.csv",header=TRUE)       #reads the data

global.model<-lmer(yld.res ~ rain + brk + onset + wid + (1|state),data=data1,REML="FALSE")               # prepares a global model

stdz.model <- standardize(global.model,standardize.y = FALSE)          # standardise the input varaibles 

model.set <- dredge(stdz.model)      ### generates the full submodel set

top.models <- get.models(model.set, subset= delta<2)   # selects models with delta AIC <2

model.avg(top.models)       # calculates the average effect size of input variables

这是结果model.avg(top.models)给出每个输入变量的平均效应大小

Coefficients: 
         (Intercept)     brk         rain         wid        onset
subset -4.281975e-14   -106.0919   51.54688    39.82837    35.68766

我阅读了标准化函数的工作原理 - 减去平均值并除以 2SD。

我的问题是:既然我已经标准化了输入变量,那么效应大小不应该在-1到1之间吗?或者输出显示的效果大小是正确的?

请指教

多谢


这更像是一个统计问题而不是编程问题,但是:您只标准化了预测变量,而不是响应变量(您指定standardize.y=FALSE);因此,每个系数代表预测变量中每 2 个 SD 变化的预期响应变化(以响应单位表示!)。如果响应的范围很大(在您的示例中一定如此),那么可能会有很大的变化。例如,如果我正在分析以毫克为单位的大象体重的变化,我可以预期预测变量(例如性别、年龄、食物供应量)的相当小的变化的响应会发生很大的变化。你可能应该使用standardize.y=TRUE如果您想要真正的无量纲/无单位效应大小。即使无量纲效应也不一定限制在 -1 和 +1 之间,但它们如此之大会令人惊讶。

顺便说一句,我认为你的standardize函数来自于arm包,不是来自MuMIn (library("sos"); findFn("standardize",sortby="Function)).

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

R 中 MuMIn 包的标准化 的相关文章

  • rmarkdown 中的内部链接不起作用

    我使用 rmarkdown 来渲染 pdf 文档 现在我想在文本中添加内部链接 在帮助页面中降价 http rmarkdown rstudio com authoring pandoc markdown html links 它说内部链接定
  • 将 data.frame 的列中的值替换为另一个 data.frame 中的值

    我的情况是 我有一个数据框 其中有一列填充了整数 1 到 6 我想用更具描述性的标签替换这些整数 这些标签在另一个充当 键 的数据框中提供 V1 V2 1 1 LABEL1 2 2 LABEL2 3 3 LABEL3 4 4 LABEL4
  • 反转默认比例梯度ggplot2

    我是新手 我正在尝试设计热图 这是我的代码 ggplot gd aes Qcountry Q6 1 Q6d order TRUE geom tile aes fill prob colour white theme minimal labs
  • R:错误消息---包错误:“functionName”未从当前命名空间解析

    我正在使用一个一直运行到 R3 0 的软件包 问题如上所述 当我们调用在 R 2 15 2 中工作的函数时 从 R 3 0 开始我们得到一个错误 Error in C solarspectrum3 as double lon as doub
  • 在 Shiny 中使用 readlines(prompt = )

    我有一个代码 使用以下方式获取输入readlines prompt 功能 您能告诉我 Shiny 中的哪个输入函数足以将此代码适应 Shiny 应用程序吗 我需要一个交互功能 我无法使用简单的输入selectInput 因为我有很多read
  • R 中 write.table 文件名中的变量

    请帮助我解决一个幼稚的问题 已经用谷歌搜索 并尝试了很多变体 但失败了 如何使用 R 中 write table 的文件名中的变量保存文件 脚本循环遍历 dir 中的文件 应用一些函数 然后将结果保存到具有相同名称但附加结尾的文件中 谢谢
  • r Shiny 中的 fileInput 函数没有响应

    我是 R 和 R闪亮的新手 一直致力于构建一个统计应用程序 该应用程序将允许用户导入文件 然后对数据运行不同的统计程序 直到最近 fileData 函数一直对我来说运行良好 现在每当我尝试上传文件时 都不会打开任何内容 我已尝试了所有我能想
  • R 条形图中的 X 轴

    我想问一个关于 barplot 轴的问题 首先请看我的数据 SerNo DOY Rain 1 350 0 2 351 0 3 352 0 4 353 0 5 354 0 6 355 0 7 356 0 8 357 0 9 358 0 10
  • 如何用日语创建 ggplot2 标题?

    我正在准备日语演示文稿 并希望图像的标题和图例名称为日语 我可以让文本在 RStudio 中渲染得很好 但是当渲染图像时 日语字符仅显示为方框 x 10 10 y x x df data frame x y ggplot df aes x
  • 使用 SparkR 1.5 从 RStudio 中的 hdfs 读取大文件(纯文本、xml、json、csv)的选项

    我是 Spark 新手 想知道除了下面的选项之外是否还有其他选项可以使用 SparkR 从 RStudio 读取存储在 hdfs 中的数据 或者我是否正确使用它们 数据可以是任何类型 纯文本 csv json xml 或任何包含关系表的数据
  • R:使用管道将单个参数传递到函数中的多个位置

    我试图专门使用管道来重写以下代码 使用babynames包中的babynames数据 library babynames library dplyr myDF lt babynames gt group by year gt summari
  • 在ggplot2中创建部分虚线

    我正在 R 中创建一个图 并且需要创建一条线 其中某些值是投影 投影用虚线表示 这是代码 df data frame date c rep 2008 2013 by 1 value c 303 407 538 696 881 1094 gg
  • 我可以调整scale_color_brewer的下限吗?

    我已经订购了我想使用 color Brewer 的分类数据 但我很难看到非常低的值 有没有办法去掉这些较低的值或设置范围的下限 ggplot data frame x 1 6 y 10 15 w letters 1 6 aes x y co
  • 如何在 R 中查找平衡面板数据(又名,如何查找面板中的哪些条目在给定窗口内完整)

    我有来自 Compustat 的大量数据 我向其中添加了一些手工收集的数据 认真地从一堆旧书中手工收集 但我不想手工收集整个面板 只想随机选择一个子集 为了找到更大的集合 我从中随机选择 我想从 Compustat 的平衡面板开始 我看到p
  • 创建序列组合

    我正在尝试解决以下问题 考虑 5 个简单序列 0 100 100 0 rep 0 101 rep 50 101 rep 100 101 我需要 3 个数字变量的集合 它们的所有组合都具有上述序列 由于有 5 个序列和 3 个变量 因此可以有
  • 在 R Shiny 中显示/隐藏整个框元素

    我目前正在尝试找到一种方法来隐藏 显示 R Shiny 中的整个 box 元素 以及里面的所有内容 我想创建一个可能的按钮 它允许用户展开特定框 然后使用相同 甚至不同 的按钮隐藏它 我不想使用条件面板 因为我的应用程序非常大并且会产生一些
  • 如何将 mcmc.list 转换为 bugs 对象?

    我正在使用rjagsR 库 功能coda samples产生一个mcmc list 例如 来自example coda samples library rjags data LINE LINE recompile LINE out lt c
  • 使用 dplyr 的 select 引用变量名[重复]

    这个问题在这里已经有答案了 通常我会想要选择变量的子集 其中该子集是函数的结果 在这个简单的例子中 我首先获取与宽度特征相关的所有变量名称 library dplyr library magrittr data iris width var
  • 在 R 中收集多组列[重复]

    这个问题在这里已经有答案了 我有一个宽数据框 需要将其收集或融化成一个高数据框 我遇到的问题是我有几组列需要保持关联 分组 我每个表单提交有 2 个用户 每个用户有 3 列数据 我想将这 6 列基本上以 3 组的形式堆叠起来 以便每个用户都
  • 当在另一行中找到元素逗号分隔时合并行

    您好 我有一个数据框 例如 species family Events groups 1 SP1 A 10 22 G1 2 SP1 B 7 G2 3 SP1 C D 4 5 6 1 3 G3 G4 G5 G6 4 SP2 A 22 10 G

随机推荐

  • 如何在Java中高性能地显示多个SVG

    我想要的是 我的目标是能够在 Java 的单个绘图区域上显示大量 SVG 图像 每个图像都有自己的平移 旋转 缩放值 我正在寻找允许此操作的最简单的解决方案 甚至可以选择使用 OpenGL 来加快速度 我尝试过的 我最初的幼稚方法是使用 S
  • 带或不带加窗的 KISS FFT 输出

    我目前正在尝试使用 Kiss fft 将 fft 实现到 avr32 微控制器中 以进行信号处理 我的输出有一个奇怪的问题 基本上 我将 ADC 样本 使用函数生成器进行测试 传递到 fft 实际输入 256 n 大小 中 并且检索到的输出
  • 如何在C中读取和覆盖文本文件?

    我有一个文本文件 text txt 其内容为 为了简单起见 this is line one this is line two this is line three 再次为了简单起见 我只是尝试将每行中的第一个字符设置为 x 所以我想要的结
  • 当“myType”在运行时动态生成时,鉴别器“myType”不明确

    我有一个应用程序 它在运行时动态创建新类型 创建该类型的对象并将它们插入到类型的 MongoDB 数据库集合中object 使用 shell 我可以看到对象已正确插入并且 tvalue 是动态创建的类的正确名称 我正在尝试使用以下方法从我的
  • KeyCloak 用户联合和动态角色

    我正在使用本指南http www keycloak org docs 3 2 server development topics user storage html http www keycloak org docs 3 2 server
  • 如何在 Python 中生成随机字符串(长度为 X,仅 a-z)? [复制]

    这个问题在这里已经有答案了 可能的重复 python 生成带有大写字母和数字的随机字符串 https stackoverflow com questions 2257441 python random string generation w
  • 使用 Firefox(最新 32 位)浏览器的量角器未加载

    因此 由于某种原因 当我运行 Protractor 时 Firefox 最新 32 只会打开一个空浏览器 并且不会导航到 baseURL 我编写的测试在 Chrome 上工作得很好 但在 Firefox 上却不行 这可能与conf文件的设置
  • 如何从 Android 的 Google 获取当前时间? [关闭]

    Closed 这个问题正在寻求书籍 工具 软件库等的推荐 不满足堆栈溢出指南 help closed questions 目前不接受答案 是否有 Google API 可以从时区获取当前时间 如果有 我该如何使用它 我想从特定时区获取当前在
  • Android 中同时播放多个视频文件

    我曾在 iPad 上对 iOS 提出过同样的问题 但现在我想看看在 Android 中是否可行 目前我收到的回复是 iOS 内没有 如果在 Android 中可行 请解释一下使用了什么 API 这是我引用的原始问题 iOS 上的原始帖子可在
  • 如何枚举 SQL 中返回的行?

    我想知道是否可以枚举返回的行 不根据任何列内容 而只是产生一个顺序整数索引 例如 select count as usercount from users group by age 会返回类似的内容 1 12 2 78 3 4 4 42 那
  • 无法解析符号“createFromResource”

    我完全不明白这意味着什么 我已经进行了一些搜索 但到目前为止还没有找到任何帮助 我正在使用 android studio 并有一个对话框片段 我正在其中设置一个微调器 Spinner systemFontSpinner Spinner vi
  • Seaborn 热图更改 yticks 的日期频率

    我的问题与该主题遇到的问题类似 更改多索引数据帧的热图 xticks https stackoverflow com questions 66897981 change heatmaps yticks for multi index dat
  • 本地主机上的谷歌距离矩阵

    我正在尝试使用谷歌距离矩阵来找出从一个源到一个目的地的距离和时间 我正在调用该函数 postCode change function var address sydney var source melbourne var url https
  • EL 中的#{component} 到底是什么?

    根据https code google com p primefaces issues detail id 4720 https code google com p primefaces issues detail id 4720 The
  • GTK信号什么时候发出

    给定从用户连接到回调函数的信号 gtk main 线程将休眠 直到发出信号 我搜索了有关如何或何时发出的详细信息 但找不到任何我不知道的信息 更具体地说 它是异步发出的 以便我可以在某个函数中间调用信号 还是等待特定函数先返回 发出 切换页
  • CKReference 的 CloudKit 订阅通知未按预期工作

    我正在尝试为包含带有用户 CKReference 的字段的记录设置 CKSubscription 但每当创建记录时 它都会忽略compoundPredicate的这一部分 并且通知永远不会出现 在 CKSubscription 的谓词中使用
  • 我可以使用本地文件系统中的图像作为 HTML 的背景吗? [复制]

    这个问题在这里已经有答案了 我有一个托管在远程 Web 服务器上的 HTML 文档 我试图让网页上的元素之一使用本地文件系统中的图像文件作为其背景图像 Chrome Safari 或 Firefox 都不行 还没有尝试过 IE 这是我迄今为
  • 如何通过验证保留 JSF 视图参数

    我将 JSF 2 0 CDI 和 PrimeFaces 2 2 1 用于许多 CRUD 表单 这些表单允许用户通过单击数据表中的链接来查看或更新现有实体的属性 其中实体的标识符被传递到CRUD 形式作为视图参数 我在 PrimeFaces
  • 内存是否加密?

    我想将一些数据存储在变量中 并且我知道变量存储在内存中 内存中的数据是否被加密 另外 软件是否可以读取存储在内存中的变量名称并能够从中实际提取数据 内存是not在我所知道的任何平台上进行加密 无论如何 它的价值有限 因为处理器通常必须对明文
  • R 中 MuMIn 包的标准化

    我使用 R 中的 MuMIn 包来选择模型并计算输入变量 rain brk onset wid 的效应大小 为了使变量之间的效应大小具有可比性 我使用标准化函数对它们进行了标准化arm包裹 这是我正在遵循的代码 供参考 请参阅本文附录 ht