Dask 连接的简单方法(水平,轴=1,列)

2024-01-01

Action将两个 csv(data.csv 和 label.csv)读取到单个数据帧。

df = dd.read_csv(data_files, delimiter=' ', header=None, names=['x', 'y', 'z', 'intensity', 'r', 'g', 'b'])
df_label = dd.read_csv(label_files, delimiter=' ', header=None, names=['label'])

Problem列的串联需要已知的划分。然而,设置索引会对数据进行排序,这是我明确不希望的,因为两个文件的顺序是它们的匹配。

df = dd.concat([df, df_label], axis=1)
---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-11-e6c2e1bdde55> in <module>()
----> 1 df = dd.concat([df, df_label], axis=1)

/uhome/hemmest/.local/lib/python3.5/site-packages/dask/dataframe/multi.py in concat(dfs, axis, join, interleave_partitions)
    573             return concat_unindexed_dataframes(dfs)
    574         else:
--> 575             raise ValueError('Unable to concatenate DataFrame with unknown '
    576                              'division specifying axis=1')
    577     else:

ValueError: Unable to concatenate DataFrame with unknown division specifying axis=1

Tried添加一个'id' column

df['id'] = pd.Series(range(len(df)))

然而,Dataframe 的长度导致 Series 大于内存。

Question显然 Dask 知道两个 Dataframe 具有相同的长度:

In [15]:
df.index.compute()
Out[15]:
Int64Index([      0,       1,       2,       3,       4,       5,       6,
                  7,       8,       9,
            ...
            1120910, 1120911, 1120912, 1120913, 1120914, 1120915, 1120916,
            1120917, 1120918, 1120919],
           dtype='int64', length=280994776)
In [16]:
df_label.index.compute()
Out[16]:
Int64Index([1, 5, 5, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2,
            ...
            3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3],
           dtype='int64', length=280994776)

如何利用这些知识来简单地连接?


解决方案(来自@Primer的评论):

  • 重新分区和重置索引
  • 使用分配而不是连接

最终代码;

import os
from pathlib import Path
import dask.dataframe as dd
import numpy as np
import pandas as pd



df = dd.read_csv(['data/untermaederbrunnen_station1_xyz_intensity_rgb.txt'], delimiter=' ', header=None, names=['x', 'y', 'z', 'intensity', 'r', 'g', 'b'])
df_label = dd.read_csv(['data/untermaederbrunnen_station1_xyz_intensity_rgb.labels'], header=None, names=['label'])
# len(df), len(df_label), df_label.label.isnull().sum().compute()

df = df.repartition(npartitions=200)
df = df.reset_index(drop=True)
df_label = df_label.repartition(npartitions=200)
df_label = df_label.reset_index(drop=True)

df = df.assign(label = df_label.label)
df.head()
本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

Dask 连接的简单方法(水平,轴=1,列) 的相关文章

  • scipy.optimize on pandas dataframe

    我试图搜索它 但结果很差 有人可以向我解释一下如何在 Pandas DataFrame 上执行 optimize minimize 以便最小化 DataFrame 中的类别和结果列之间的错误 考虑这个例子 import pandas as
  • 键入的完整命令行

    我想获得输入时的完整命令行 This join sys argv 在这里不起作用 删除双引号 另外 我不想重新加入已解析和拆分的内容 有任何想法吗 你太迟了 当键入的命令到达 Python 时 您的 shell 已经发挥了它的魔力 例如 引
  • 为什么在连接两个字符串时 Python 比 C 更快?

    目前我想比较 Python 和 C 用来处理字符串的速度 我认为 C 应该比 Python 提供更好的性能 然而 我得到了完全相反的结果 这是 C 程序 include
  • 使用 NumPy 编写一个函数来计算具有特定公差的积分

    我想编写一个自定义函数来以特定容差对表达式 python 或 lambda 函数 进行数字积分 我知道与scipy integrate quad人们可以简单地改变epsabs但我想使用 numpy 自己编写该函数 From 这篇博文 htt
  • 设置高亮大括号的 vim 颜色主题

    如何更改突出显示大括号的 vim 配色方案 我希望实际编辑 vim 主题文件以使更改永久生效 问候 克雷格 匹配括号的自动高亮颜色称为MatchParen 您可以通过执行以下操作来更改 vimrc 中的颜色 highlight MatchP
  • 高级描述熊猫

    有没有像 pandas 那样更高级的功能 通常我会继续这样 r pd DataFrame np random randn 1000 columns A r describe 我会得到一份很好的总结 就像这样 A count 1000 000
  • 更改 Matplotlib 投影轴的背景颜色

    我正在尝试使用 Cartopy 创建一个图形 该图形需要在未投影的轴上绘制投影轴 这是一个尽可能简单的代码版本 它将轴上的内容替换为背景颜色 import matplotlib pyplot as plt import cartopy cr
  • 无法使用 python rasterio、gdal 打开 jp2 (来自哨兵)

    我试图在 python 中将 jp2 栅格产品作为栅格打开 但当我们使用 raterio 和 gdal 包时没有成功 我收到此错误 RasterioIOError b4 jp2 not recognized as a supported f
  • Django 2、python 3.4 无法解码 urlsafe_base64_decode(uidb64)

    我正在尝试通过电子邮件激活用户 电子邮件有效 编码有效 我使用了 django1 11 中的方法 该方法运行成功 在 Django 1 11 中 以下内容成功解码为 28 其中 uidb64 b Mjg force text urlsafe
  • 从 wxPython 事件处理程序中调用函数

    我正在努力寻找一种在 wxPython 事件处理函数中使用函数的方法 假设我有一个按钮 单击该按钮时 它会使用事件处理程序运行一个名为 OnRun 的函数 但是 用户忘记单击 OnRun 按钮之前的 RadionButton 我想弹出一个
  • 从迭代器外部将 StopIteration 发送到 for 循环

    有几种方法可以打破一些嵌套循环 他们是 1 使用中断 继续 for x in xrange 10 for y in xrange 10 print x y if x y gt 50 break else continue only exec
  • Django 将 JSON 数据传递给静态 getJSON/Javascript

    我正在尝试从 models py 中获取数据并将其序列化为views py 中的 JSON 对象 模型 py class Platform models Model platformtype models CharField max len
  • Python:如何在不先创建整个列表的情况下计算列表的总和?

    通常我们必须 1 声明一个列表 2 使用以下方法计算该列表的总和sum 但现在我希望指定一个以 1 开头 间隔为 4 100 个元素的列表 如下所示 1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 我不想涉及数学公式 所以 1 如何在
  • Python 读取未格式化的直接访问 Fortran 90 给出不正确的输出

    这是数据的写入方式 它是一个二维浮点矩阵 我不确定大小 open unit 51 file rmsd nn output form unformatted access direct status replace recl Npoints
  • 如何使用 enumerate 来倒数?

    letters a b c 假设这是我的清单 在哪里for i letter in enumerate letters 将会 0 a 1 b 2 c 我怎样才能让它向后枚举 如 2 a 1 b 0 c 这是一个很好的解决方案并且工作完美 i
  • python中有没有一种方法可以将存储在列表中的正则表达式模式列表应用到单个字符串?

    我有一个正则表达式模式列表 存储在列表类型中 我想将其应用于字符串 有谁知道一个好方法 将列表中的每个正则表达式模式应用于字符串 和 如果匹配 则调用与列表中该模式关联的不同函数 如果可能的话我想用 python 来做这件事 提前致谢 im
  • Python 相当于 Scala 案例类

    Python 中是否有与 Scala 的 Case Class 等效的东西 就像自动生成分配给字段而无需编写样板的构造函数一样 当前执行此操作的现代方法 从 Python 3 7 开始 是使用数据类 https www python org
  • 没有名为“turtle”的模块

    我正在学习并尝试用Python3制作贪吃蛇游戏 我正在进口海龟 我正在使用 Linux mint 19 PyCharm python37 python3 tk Traceback most recent call last File hom
  • pandas.read_fwf 忽略提供的数据类型

    我正在从文本文件导入数据框 我想指定列的数据类型 但 pandas 似乎忽略了dtype input 一个工作示例 from io import StringIO import pandas as pd string USAF WBAN S
  • 如何使用 Python/Django 在 Facebook 中获取(和使用)扩展权限

    我正在尝试编写一个简单的应用程序 让用户授予我的代码写入其页面的 Facebook 流的权限 据我了解 它应该很简单 让用户单击一个按钮 启动一个弹出窗口 其中包含我的 Facebook 应用程序中的页面 在该页面中 他们单击授予的内容流发

随机推荐