嵌套 R foreach 循环中的外循环变量

我试图在嵌套循环中使用 foreach 包，但我的内部循环无法识别外部的计数器，我错过了什么？

v3 <- search.compounds.by.mass(100.05,0.5)
foreach(j=2:length(v2)) %:% {
    foreach(i=1:length(v3), .combine=rbind) %dopar% {
        write.table(paste(v3[i], paste(get.reactions.by.compound(v3[i]), collapse=" "), sep=" "), "file1",quote=FALSE, row.names=FALSE, col.names=FALSE, append=TRUE)
        write.table(paste(v3[i], paste(get.pathways.by.compounds(v3[i]), collapse=" "), sep=" "), "file2",quote=FALSE, row.names=FALSE, col.names=FALSE, append=TRUE)
        v3 <- search.compounds.by.mass(v2[j],0.5)
    }
}

问题是你错误地应用了%:%操作员。它旨在合并两个foreach对象，从而产生单个foreach对象可用于重复评估您提供给它的任何表达式。所以，如果你想使用%:%， 你需要first合并两个foreach()声明，以及then使用结果对象来驱动单个调用%do%（或者就你而言，%dopar%). See (1)下面举个例子。

或者，如果您想嵌套两个foreach()对象、使用%do%两次，如(2) below.

无论哪种方式都有效，尽管对于并行作业我可能更喜欢使用%:%。不过，你的代码就像(3)下面，结合了两种策略的元素来产生一个什么也做不了的混合体。

X <- c("A", "B")
Y <- 1:3

## (1) EITHER merge two 'foreach' objects using '%:%' ...
foreach (j = X, .combine = c) %:% foreach(i = Y, .combine = c) %do% {
    paste(j, i, sep = "")
}
# [1] "A1" "A2" "A3" "B1" "B2" "B3"


## (2) ... OR Nest two 'foreach' objects using a pair of '%do%' operators ...
foreach(j = X, .combine = c) %do% {
    foreach(i = Y, .combine = c) %do% {
        paste(j, i, sep = "")
    }
}
# [1] "A1" "A2" "A3" "B1" "B2" "B3"


## (3) ... BUT DON'T use a hybrid of the approaches.
foreach(j = X, .combine = c) %:% {
    foreach(i = Y, .combine = c) %do% {
        paste(j, i, sep = "")
    }
}
# Error in foreach(j = X, .combine = c) %:% { : 
#   "%:%" was passed an illegal right operand