R 中的 pheatmap 格式:图例大小并创建方形图

2024-01-13

Pheatmap 仅在 legend=FALSE 时创建方形图。我尝试使用 par() 来允许更多 oma() 和 mar() 空间,但运气不佳。图例也很大,我找不到任何有关减少此图例或更改其位置的文档。第一个图没有安装树状图,但这与尺寸问题无关。无论聚类如何,都会发生同样的情况。如果有任何意见,我将不胜感激

png(filename="tmpfile.png", width=1500, height=1500, res=500)
pheatmap(res, cluster_rows=FALSE, cluster_cols=FALSE, main="Default_clust", annotation=res2, color = rainbow(n, start=.7, end=.1), show_rownames=FALSE, show_colnames=FALSE, border_col=NA, fontsize=6)
dev.off()

关于平方图的问题实际上与绘制皮尔逊相关性非常相关。我来这里希望得到答案,最后我想出了一个解决方法来手动设置单元格宽度,例如:

pheatmap(...,     
cellheight=3, cellwidth = 3)

但我想要一个更好的方法。

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