如何使用 knit 和 pandoc 在 R Markdown 中包含 DT 数据表的 js 依赖项

有没有办法在 RStudio 之外使用 DT 生成的数据表来编译 RMarkdown 文档？

我试图在 RMarkdown 文档中包含一个数据表小部件，然后我想使用 knit 和 pandoc 将其转换为 html。这对于 RStudio 来说效果很好，但是如果我尝试对 knit 和 pandoc 做同样的事情，我将无法获得工作的 html 文件。

下面是一个 Rmd 文件的最小示例，它可以与 RStudio 一起使用，但不能与 RStudio 一起使用：

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title: "Minimal DT example"
---

<style type="text/css"> table, table th, table td {   border: none; } </style>

```{r} 
library(DT) 
datatable(iris) 
```

然后我想使用以下方法将其转换为 html：

knitr::knit('example.Rmd')
knitr::pandoc('example.md',format="html")

我知道 RStudio 使用更复杂的 pandoc 调用：

/usr/lib/rstudio/bin/pandoc/pandoc scratch.utf8.md --to html --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash-implicit_figures --output scratch.html --smart --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template /home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/rmarkdown/rmd/h/default.html --variable 'theme:bootstrap' --include-in-header /tmp/RtmpMLtVfF/rmarkdown-str24935297671d.html --mathjax --variable 'mathjax-url:https://cdn.mathjax.org/mathjax/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML' --no-highlight --variable highlightjs=/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/rmarkdown/rmd/h/highlight

我可以重新创建该 tmp 文件包含在标头中的部分：

/tmp/RtmpMLtVfF/rmarkdown-str24935297671d.html

我假设该文件包含 jquery 和数据表的 js 源。我尝试从包源中手动添加它们 - 但没有成功 - 并且无论如何都希望有一个开箱即用的解决方案。

RStudio 在后台使用的软件包是rmarkdown。它处理 Knit 命令并将工作委托给 knit 和 pandoc，它还负责捆绑依赖项并将它们注入到文档中。

您可能已经安装了该软件包，因此您应该能够一次性生成 HTML 文件：

rmarkdown::render('example.Rmd')

更多资源：

CRAN 上的 RMarkdown http://cran.r-project.org/web/packages/rmarkdown/index.html

RMarkdown介绍 http://rmarkdown.rstudio.com/