R 中更快的模数或相等检查(或矢量化的好方法)

2024-03-04

我一直在运行欧拉项目,试图编写计算效率高的程序。考虑问题1:http://projecteuler.net/problem=1 http://projecteuler.net/problem=1。我将范围从 1000 提高到 10,000,000 以突出效率低下的情况。

这是我的解决方案:

system.time({
    x <- 1:1E7
    a <- sum(as.numeric(x[x%%3 ==0 | x%%5==0]))
})
 user  system elapsed 
0.980   0.041   1.011

这是朋友编写的一些 C++ 代码,用于执行相同的操作。

#include <iostream>
using namespace std;

int main(int argc, char** argv)
{
 long x = 0;
 for (int i = 1; i < 10000000; i++)
 {
   if (i % 3 == 0)
     x += i;
   else if (i % 5 == 0)
     x += i;
 }
 cout << x;
 return 0;
}
cbaden$ time ./a.out
23333331666668
real    0m0.044s
user    0m0.042s
sys     0m0.001s

我知道 C++ 应该比 R 更快,但是this快多了? Rprof 指出,我将近 60% 的时间花在模运算符上,13% 的时间花在“==”运算上。有没有矢量化的方法可以更快地做到这一点?

第二个担心是我会耗尽内存——随着范围变大,这种方法的可扩展性不太好。有没有一种好方法可以保留可矢量化性,但不会尝试将子集保留在内存中?


模数运行时速度更快integer是而不是numerics:

f1 <- function() {
   x <- 1:1E7
   a <- sum(as.numeric(x[x%%3 ==0 | x%%5==0]))
}

f2 <- function() {
   x <- 1:1E7
   a <- sum(as.numeric(x[x %% 3L == 0L | x %% 5L == 0L]))
}

library(rbenchmark)
benchmark(f1(), f2(), replications = 5)
#   test replications elapsed relative user.self sys.self user.child sys.child
# 1 f1()            5   14.78 4.976431     13.95     0.67         NA        NA
# 2 f2()            5    2.97 1.000000      2.37     0.50         NA        NA

这距离 C++ 的性能还很远,但这是朝着正确方向迈出的一步。

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

R 中更快的模数或相等检查(或矢量化的好方法) 的相关文章

  • 如何使用 R 将每个文件的数据添加为附加行,从而将不同的 .csv 文件合并为一个完整的文件?

    我有几个不同的文件夹 它们都包含一个 csv 文件 所有这些 csv 文件都有一个单独的列 其中包含实验的一种条件的数据 我想以将每个文件的数据添加为新列的方式合并这些 csv 文件 目前 它看起来像这样 C1 csv 102 106 15
  • dplyr 返回每个组的全局平均值,而不是每个组的平均值

    有人可以解释一下我在这里做错了什么 library dplyr temp lt data frame a c 1 2 3 1 2 3 1 2 3 b c 1 2 3 1 2 3 1 2 3 temp gt group by temp 1 g
  • 一段 R 代码会影响 foreach 输出中的随机数吗?

    我使用运行模拟foreach and doParallel并与随机数 名为random在代码中 简而言之 我模拟一个足球联赛 随机生成所有比赛的获胜者以及相应的结果 在dt base没有比赛进行 在dt ex1 and dt ex24场比赛
  • randomForest 包在删除一个预测类时的奇怪行为

    我正在运行一个随机森林模型 它产生的结果从统计角度来看对我来说完全没有意义 因此我确信有些东西mustrandomForest 包的代码出现错误 至少在模型的本次迭代中 预测 左侧变量是具有 3 种可能结果的政党 ID 民主党 独立党 共和
  • 如何在 R 中合并同名列表中的数据框?

    我有一个包含很多数据框的列表 如果它们具有相同的名称 我想合并它们 即合并所有具有相同名称 a 和 b 的数据框 像这样 a lt aaaaa b lt bbbbb c lt ccccc g lt list df1 lt data fram
  • 将字符串列拆分为多个虚拟变量

    作为 R 中 data table 包的相对缺乏经验的用户 我一直在尝试将一个文本列处理为大量指示符列 虚拟变量 每列中的 1 表示特定的子字符串是在字符串列中找到 例如我想处理这个 ID String 1 a b 2 b c 3 c 进入
  • 将 ftransform 与折叠 R 包中的 fgroup_by 一起使用

    我正在尝试重现以下输出dplyr代码与R包裹collapse dplyr Code library tidyverse starwars gt select name mass species gt group by species gt
  • 使用 R 下载压缩数据文件、提取和导入数据

    EZGraphs 在 Twitter 上写道 很多在线 csv 都被压缩了 有没有办法下载 解压缩存档并使用 R 将数据加载到 data frame Rstats 我今天也尝试这样做 但最终只是手动下载 zip 文件 我尝试过类似的东西 f
  • R中的重叠矩阵

    我有以下数据框 id channel 1 a 1 b 1 c 2 a 2 c 3 a 我想创建并重叠矩阵 它基本上是一个方阵 行和列标签为 a b c 表中的每个条目显示每个通道共有多少个 id 例如 在上面的例子中 矩阵看起来像 a b
  • 访问或解析 R 中的 summary() 中的元素

    我运行以下 R 命令来进行 Dunnett 测试并获取摘要 如何访问下面线性假设的每一行 这是摘要输出的一部分 基本上我不知道摘要的结构 我尝试使用名称 但它似乎不起作用 因为我没有看到任何命名属性来提供这一点 library multco
  • 如何按时间间隔匹配数据帧?

    这是我从数据记录器导入原始数据时经常出现的问题 温度记录仪设置为每十分钟记录一次温度 单独的气体记录仪设置为记录最后十分钟间隔内使用的气体 我想将这两个记录器的数据合并到一个数据框中进行绘图和分析 但时间并不完全一致 我希望每十分钟的时间段
  • 如何纠正 data.frame 上的字符编码

    我有一个像这样的数据框 data names lt data frame DATA c 1 5 rownames data names lt c IV xc1N JOS xc9 LUC xcdA RAM xd3N TO xd1O data
  • 如何在 R 中执行近似(模糊)名称匹配

    我有一个专门用于生物学期刊的大型数据集 该数据集是由不同的人长时间编写的 因此 数据不采用单一格式 例如 在 作者 栏中我可以找到John Smith Smith John Smith J等 但它们是同一个人 我连最简单的动作都做不了 例如
  • 为什么 sapply 的缩放速度比样本大小的 for 循环慢?

    假设我想采用向量 X 2 1 N 并将 e 计算为每个元 素的指数 是的 我认识到最好的方法就是通过向量化 exp X 但这样做的目的是将 for 循环与 sapply 进行比较 我通过逐步尝试三种方法 一种使用 for 循环 两种以不同方
  • 如何在 R 中的 for 循环内将值存储在向量中

    我正在开始使用 R 但我对以下问题感到非常沮丧 我试图将 for 循环内完成的某些计算的值存储到我之前定义的向量中 问题是如何进行索引 因为for循环迭代代码的次数取决于用户的输入 所以变量i不一定要从1开始 它可以从80开始 for举个例
  • `as.matrix` 和 `as.data.frame` S3 方法与 S4 方法

    我注意到定义as matrix or as data frame作为 S4 类的 S3 方法 使例如lm formula objS4 and prcomp object 开箱即用 如果它们被定义为 S4 方法 则这不起作用 为什么将方法定义
  • 如何声明包含 M 个元素的列表对象

    我想声明一个包含 M 3 x 3 矩阵的列表 如果我事先知道数字 M 那么我可以通过以下方式声明这样的列表 elm lt matrix NA 3 3 Say M 7 myList lt list elm elm elm elm elm el
  • 如何为自定义 S3 类实现提取/取子集 ([ [<-, [[ [[<-)] 函数?

    我有一个自定义的 S3 类foo 它在正常的基础上添加了一些自定义行为data frame foo object lt data frame class foo object lt c foo data frame 对于这个类 还应该有一个
  • 需要在R中跳过不同数量的行

    我正在使用以下代码来处理我的数据 但最近我意识到使用skip 27 在数据开始之前跳过存储在我的文件中的信息 不是一个好的选择 因为每个文件中要跳过的行数不同我的目标是读取存储在多个文件夹中的各种txt文件 并非所有文件都有相同的列数 列的
  • case_when 与部分字符串匹配和 contains()

    我正在使用一个数据集 其中有许多名为 status1 status2 等的列 在这些列中 它表示某人是否豁免 完整 注册等 不幸的是 豁免投入并不一致 这是一个示例 library dplyr problem lt tibble perso

随机推荐