使用mathtype往论文中插入公式时，若需要编号，则点击“右编号”（若只需插入文本行内，则点“内联”）
由于论文是分栏格式，单行公式太长导致编号串行，因此需要将公式进行拆分。
拆分时直接在换行处按“Enter”，然后通过ctrl+alt+space调整公式实现所需要的对齐。
由于正文内容使用了固定行距，导致公式不能显示完全。
可将行距修改为单倍行距，同时为了解决整个文档由于插入公式导致的行距不一致的情况，可取消勾选“如果定义了文档网格，则对齐到网格”。
现在公式完整显示了，但是编号并未与公式的最后一行对齐。
选择编号，进行字体格式修改，修改位置为“降低”一定的磅值，磅值根据自己的情况进行调整。
现在编号与公式最后一行对齐了，但是公式大小与文档其他文字不一致（我的情况显然是公式太大了）
①只修改当前公式大小：打开MathType公式编辑器软件。单击菜单栏中的“大小—定义”命令，打开“定义尺寸”对话框。在“定义尺寸”对话框中，通过更改pt值的大小可以达到修改MathType字体的效果。
由于我正文的字号是小五，根据对照表我将尺寸修改为9pt。
②批量修改公式大小，根据以上方式修改尺寸大小后，通过依次选择“预置”->“公式预置”->“保存到文件”，将这个公式的字体以文件形式保存到桌面（也可以保存到其他文件夹下面，只要自己能找到就行）。如下图所示，从保存下来的文件来看，这个文件是.eqp格式 。下面就要用这个9pt.eqp文件将其他公式批量修改即可。
依次选择mathtype、格式化公式，选择刚才保存的9pt.eqp文件 ，点击OK进行转换。
所有公式都改为和正文一致的大小（注意此时需要重新修改编号下降程度）
对于一个很长的带括号的公式，我要对它进行换行操作后，由于mathtype中的括号是自动调整大小的，这样导致括号大小不一致，情况如下：
此时可参考mathtype如何实现括号内公式换行?中的回答。
从键盘输入shift+{}或者shift+(），这时括号就不会自动变大了，括号会很小，此时我们选中一边的括号，再到mathtype工具栏输入对应的单边括号，Ctrl+Alt+space输入空格，删掉原先括号，要是还觉得小选中括号，菜单栏找到‘"大小"，选中"符号"。如果你还觉得小，找到"定义"，自己修改符号大小。
这样就很完美了。
这篇完美解决该问题：
Word 2016 撰写论文(1): 公式居中、编号右对齐
word里：
转换成的pdf中：
解决方法：
点开word，选择打印，在打印机中选择PDF Printer，保存到指定的文件夹
参考资料：word里面用mathtype编辑公式转成PDF后出现乱码
其他可参考以下链接：
Mathtype长公式换行拆分操作方法
批量修改MathType公式字体大小
Word和MathType的字体大小一致
单行数式的怎么转行分拆呢？
如何使Word中公式与文字对齐
如何解决Word中MathType公式显示不全
