我有一个 Java 应用程序需要执行偏最小二乘回归。似乎没有 PLSR 的 Java 实现。 Weka 可能曾经有过类似的东西，但它不再出现在 API 中。另一方面，我发现了一个很好的 R 实现，它还有一个额外的好处。它是由我想要复制其结果的人使用的，这意味着由于 PLSR 实现方式的差异而出现问题的可能性较小。
问题是：是否有一个足够好的（并且易于使用）包使 Java 能够调用 R、将一些参数传递给函数并读回结果？我的另一个选择是让 Java 在进程中生成 R，然后监视它。数据将被读取并写入磁盘。您会推荐两者中的哪一个？我错过了明显的第三个选择吗？
我过去曾成功地使用过两种替代方案。
JRI http://www.rforge.net/JRI/
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Pros: 可能性能更好。
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Cons：你必须配置一些环境变量和库，在Win/UNIX中有所不同。
RServe http://www.rforge.net/Rserve/
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Pros：易于设置，您不需要初始化 R 或链接
任何 R 库都可以在不同的机器上运行。
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Cons：基于 TCP/IP（服务器正在运行），没有来自 R 的回调。
其他替代方案我从未使用过：RCaller http://code.google.com/p/rcaller/
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