使用 dplyr 对两个变量进行嵌套或分组，然后对数据执行 Cronbach's alpha 函数或其他统计

2024-04-06

在心理学中，下面介绍的这种数据集很常见

我想group所有年龄（变量 =quest），而不是对所有尺度进行分组（com_a4_1:com_a4_6; and gm_a4_1:gm_a4_6等），然后对数据应用可靠性函数（psych::alpha).

我成功创建了这个语法

d %>% 
  select(quest,contains("_a4_")) %>% #get the data
  group_by(quest) %>%  #group by all age interval
  do(alpha(.)$total)

但是，我无法使用秤的项目“子”嵌套。

据我想象，我将不得不旋转我的数据，然后分组或嵌套。但是，我目前还没有取得任何成功。我的预期结果类似于下图。有“两个嵌套结果”。第一个结果按比例分组（例如：com_a4_1:com_a4_6），第二个按年龄分组（quest)

下面是假数据和代码

library(psych)
library(tidyverse)
d %>% 
  select(quest,contains("_a4_")) %>% #get the data
  group_by(quest) %>%  #group by all age interval
  do(alpha(.)$total)


d <-structure(list(quest = c(6, 4, 2, 4, 2, 6, 2, 4, 2, 2, 4, 2, 
                             6, 4, 4, 2, 2, 4, 2, 6, 2, 2, 4, 6, 6, 4, 4, 4, 2, 6, 4, 2, 6, 
                             4, 6, 2, 2, 4, 6, 4, 2), com_a4_1 = c(10, 0, 10, 10, 5, 10, 5, 
                                                                   10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 0, 10, 
                                                                   10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 
                                                                   10, 10), com_a4_2 = c(10, 10, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                         10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 
                                                                                         10, 10, 10, 5, 0, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 10), com_a4_3 = c(10, 
                                                                                                                                                            5, 0, 5, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 
                                                                                                                                                            10, 10, 5, 5, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                            0, 10, 5, 10, 10), com_a4_4 = c(10, 0, 0, 10, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                            10, 5, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                            10, 0, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10), 
                   com_a4_5 = c(10, 0, 0, 5, 0, 10, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 0, 
                                10, 10, 10, 0, 10, 5, 10, 0, 0, 10, 0, 10, 10, 10, 10, 5, 
                                0, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 10), com_a4_6 = c(5, 
                                                                                          10, 0, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                          10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 5, 10, 
                                                                                          5, 10, 5, 10, 0, 10, 5, 10, 10), gm_a4_1 = c(10, 10, 10, 
                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10), gm_a4_2 = c(10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                    10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                    10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                    5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10), gm_a4_3 = c(10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                               10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                               10, 10, 10, 10, 10, 10, 0, 0, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                               10, 10, 5, 10, 10, 10, 10), gm_a4_4 = c(0, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10, 0, 0, 10, 10, 10, 0, 10, 5, 5, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                       10, 10, 10, 10, 10), gm_a4_5 = c(10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                        5, 10, 10, 10, 10), gm_a4_6 = c(0, 10, 5, 5, 10, 5, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        10, 5, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 0, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        10, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 0, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        10, 10), fm_a4_1 = c(10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 0, 10, 10, 0, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 10, 10, 10), 
                   fm_a4_2 = c(10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                               10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 
                               10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10), fm_a4_3 = c(0, 
                                                                                                  5, 10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 5, 5, 5, 
                                                                                                  10, 10, 5, 0, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 10, 10, 
                                                                                                  10, 0, 10, 0, 10, 10, 10, 10), fm_a4_4 = c(10, 5, 10, 10, 
                                                                                                                                             10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                             10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                             10, 10, 0, 10, 10, 10, 10), fm_a4_5 = c(0, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                     0, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 10, 10, 5, 0, 10, 
                                                                                                                                                                                     10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 0, 5, 10, 0, 10, 0, 5, 5, 
                                                                                                                                                                                     5, 10, 10, 10), fm_a4_6 = c(10, 5, 5, 0, 0, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                 0, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 0, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 
                                                                                                                                                                                                                 0, 0, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 5, 10, 0, 0, 10, 10, 5), 
                   cg_a4_1 = c(10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                               10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 10, 10, 5, 0, 
                               10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 10, 10), cg_a4_2 = c(5, 
                                                                                                 10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10), cg_a4_3 = c(10, 
                                                                                                                                                      10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                      5, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 
                                                                                                                                                      10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10), cg_a4_4 = c(10, 10, 0, 
                                                                                                                                                                                                      5, 5, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 0, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                      10, 10, 0, 5, 10, 10, 5, 0, 0, 10, 10, 0, 10, 0, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                      5, 0, 5, 5, 10, 10), cg_a4_5 = c(5, 0, 0, 5, 0, 10, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                       10, 0, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 0, 10, 0, 10, 0, 0, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                       5, 10, 5, 10, 5, 5, 5, 0, 10, 10, 5, 10, 0, 10, 10, 10, 10
                                                                                                                                                                                                      ), cg_a4_6 = c(0, 0, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                     10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                     5, 10, 0, 10, 10, 5, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10), ps_a4_1 = c(10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                 10, 10, 5, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10), ps_a4_2 = c(0, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 0, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   5, 0, 10, 5, 10, 10, 10, 10), ps_a4_3 = c(10, 0, 10, 5, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             10, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             5, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 0, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             0, 10, 5, 10, 10), ps_a4_4 = c(10, 10, 10, 10, 5, 10, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            10, 10, 0, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            10, 10, 10, 10, 10, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 5, 5, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            10, 10, 10), ps_a4_5 = c(5, 5, 10, 5, 10, 5, 10, 10, 0, 0, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     10, 10, 5, 10, 10, 10, 10, 10, 0, 10, 5, 5, 5, 10, 0, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     5, 10, 5, 0, 10, 10, 10, 10, 0, 5, 0, 5, 10, 10, 5), ps_a4_6 = c(5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      5, 0, 5, 0, 10, 0, 10, 5, 5, 10, 10, 5, 10, 10, 10, 0, 10, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      5, 10, 5, 0, 5, 10, 5, 10, 5, 0, 5, 10, 0, 0, 10, 5, 0, 5, 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      0, 10, 10, 10, 10)), row.names = c(NA, -41L), class = "data.frame")

我遵循你的想法，使用更长时间的旋转pivot_longer() from tidyr将比例组放在行中，但将项目保留在列中。（文档中的最后两个示例pivot_longer()当我试图记住如何做到这一点时，这是我的首选。）

然而，这依赖于每个量表拥有相同数量的项目；我不确定它如何适应每个规模的不同项目。

一旦事物的形式较长，请使用nest_by() on quest和尺度变量后跟mutate()嵌套并计算每行的 alpha。

我没有将所有警告和消息粘贴到此处，但有很多内容。您还可以删除data如果您不再需要它，请在最后一列。

library(psych)
library(dplyr)
library(tidyr)

d %>%
    pivot_longer(cols = -quest,
                 names_to = c("scale", ".value"),
                 names_pattern = "(\\w+_\\w+_)(.)") %>%
    nest_by(quest, scale) %>%
    mutate(alpha(data)$total)

#> # A tibble: 15 x 12
#> # Rowwise:  quest, name
#>    quest name       data raw_alpha std.alpha `G6(smc)` average_r    `S/N`    ase
#>    <dbl> <chr>  <list<t>     <dbl>     <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>  <dbl>
#>  1     2 cg_a4_ [16 x 6]     0.619   0.594      0.728    0.226    1.46    0.141 
#>  2     2 com_a~ [16 x 6]     0.810   0.808      0.881    0.412    4.20    0.0719
#>  3     2 fm_a4_ [16 x 6]     0.400   0.421      0.546    0.108    0.728   0.221 
#>  4     2 gm_a4_ [16 x 6]     0.842   0.952      0.745    0.831   19.7     0.0592
#>  5     2 ps_a4_ [16 x 6]     0.684   0.753      0.870    0.337    3.05    0.123 
#>  6     4 cg_a4_ [15 x 6]     0.677   0.696      0.807    0.276    2.29    0.126 
#>  7     4 com_a~ [15 x 6]     0.673   0.613      0.842    0.209    1.58    0.110 
#>  8     4 fm_a4_ [15 x 6]     0.669   0.714      0.811    0.294    2.50    0.124 
#>  9     4 gm_a4_ [15 x 6]     0.811   0.759      0.873    0.386    3.15    0.0389
#> 10     4 ps_a4_ [15 x 6]     0.533   0.551      0.605    0.170    1.23    0.161 
#> 11     6 cg_a4_ [10 x 6]    -0.168  -0.00601    0.550   -0.00120 -0.00597 0.621 
#> 12     6 com_a~ [10 x 6]    -0.184   0.228      0.486    0.0686   0.295   0.644 
#> 13     6 fm_a4_ [10 x 6]     0.508   0.542      0.727    0.191    1.18    0.248 
#> 14     6 gm_a4_ [10 x 6]    -0.075  -0.492     -0.0806  -0.0582  -0.330   0.398 
#> 15     6 ps_a4_ [10 x 6]     0.844   0.879      0.903    0.592    7.26    0.0710
#> # ... with 3 more variables: mean <dbl>, sd <dbl>, median_r <dbl>

^{Created on 2021-09-23 by the reprex package https://reprex.tidyverse.org (v2.0.0)}

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