使用以下命令安装 rJava 时install.packages("rJava")命令我收到以下错误：
checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver : '/usr/bin/jar'
compiler : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'
java libs : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... yes
checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
我已经安装了 Java JDK 并且java -version返回以下内容：
$ java -version
java version "1.6.0_20"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)
当谷歌搜索错误时，我发现其他人也有同样的问题，但除了我所做的“安装整个 JDK，而不仅仅是 JRE”之外，没有找到解决方案。
我读到的另一件事是跑步sudo R CMD javareconf运行得很愉快，没有错误。
有什么想法我的问题是什么吗？
[[EDIT]]我遇到这个问题已经几个月了。我最初通过编辑 Java 路径解决了这个问题，如我下面发布的答案所示。我最近在新安装的 Ubuntu 上遇到了同样的问题。我尝试了 Dirk 的建议，使用 apt-get 安装 rJava 包。它工作得很好。我最初没有意识到的是，使用 Ubuntu apt-get 方法安装软件包与仅使用 R 内部的 install.packages() 加载相同的软件包有本质上的不同。Ubuntu 软件包解决了一些我没有意识到或欣赏的问题。
不会
apt-get install r-cran-rjava
变得更容易了吗？你可以问我useR! :)
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