如何使用aaply并保留数组中的维度顺序?

2024-05-07

我有一个 3 维数组。我想将函数应用于第三维并返回一个数组。我很高兴 plyr::aaply 几乎能满足我的要求。但是它会交换我的数组的尺寸。文档告诉我它是幂等的,这(在我查找之后)让我认为结构应该保持不变。这是一个带有恒等函数的可重现示例。我可以修改它以保留数组维度的顺序吗?

nRow <- 10
nCol <- 10
nAge <- 7

#creating the array
dimnames <- list(NULL,NULL,NULL)
names(dimnames) <- c("x","y","age")
aF <- array(0, dim=c(nCol,nRow,nAge), dimnames=dimnames)

#aaply the identity function to the 3rd dimension
aTst <- aaply(aF, .margins=3, identity )

dim(aF)
#[1] 10 10  7
dim(aTst)
#[1]  7 10 10

请参阅尺寸已从 10,10,7 更改为 7,10,10。我知道它可以使用 aperm 改回来,但如果我能避免的话那就太好了。

aTst2 <- aperm(aTst, c(2, 3, 1))

这里有一些关于我实际上想要做什么的更多细节(感谢@Simon O'Hanlon)。 x 和 y 代表 2D 空间,网格上每个单元格都有一个年龄向量。我想使用此功能移动每个年龄段:

rtMove1 <- function(m, pMove=0.4) {

  #create matrices of the 4 neighbour cells to each cell
  mW = cbind( rep(0,nrow(m)), m[,-nrow(m)] )
  mN = rbind( rep(0,ncol(m)), m[-ncol(m),] )
  mE = cbind( m[,-1], rep(0,nrow(m)) )
  mS = rbind( m[-1,], rep(0,ncol(m)) )

  mArrivers <- pMove*(mN + mE + mS + mW)/4
  mStayers <- (1-pMove)*m

  mNew <- mArrivers + mStayers
  return( mNew )
}

要启动 popn,请移动所有单元格中的所有年龄,我可以做到这一点。

#initiate 100 individuals of age 3 at 5,5
aF[5,5,3] <- 100

aTst <- aaply(aF, .margins=3, rtMove1 )

aTst[3,,]

这适用于重新分配 popn :

     1 2 3  4  5  6 7 8 9 10
  1  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  2  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  3  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  4  0 0 0  0 10  0 0 0 0  0
  5  0 0 0 10 60 10 0 0 0  0
  6  0 0 0  0 10  0 0 0 0  0
  7  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  8  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  9  0 0 0  0  0  0 0 0 0  0
  10 0 0 0  0  0  0 0 0 0  0

但如果我想重复,我需要使用 aperm 重新排列尺寸。

谢谢, 安迪


你可以尝试

aTst <- aaply(aF, c(1,2,3), identity)

这应该够了吧

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