使用 sapply 的列表和矩阵

2024-05-11

我有一个也许是基本的问题,我在网上搜索过。我在读取文件时遇到问题。尽管如此,我还是按照@Konrad的建议设法读取了我的文件,我很欣赏这一点:How to get R to read in files from multiple subdirectories under a Large Directory?

这是一个类似的问题,但是我还没有解决。

我的问题:

我在不同的文件夹中有大量具有相同名称(“tempo.out”)的文件。此 tempo.out 有 5 列/标题。它们都是相同的格式,1048行5列:

id X Y 时间 温度

setwd("~/Documents/ewat")
dat.files  <- list.files(path="./ress",
                 recursive=T,
                 pattern="tempo.out"
                 ,full.names=T)
readDatFile <- function(f) {
dat.fl <- read.table(f)  
 }

data.filesf <- sapply(dat.files, readDatFile)                         

# I might not have the right sintax in sub5:
subs5 <- sapply(data.filesf,`[`,5) 
matr5 <- do.call(rbind, subs5)   

probs <- c(0.05,0.1,0.16,0.25,0.5,0.75,0.84,0.90,0.95,0.99)
q <- rowQuantiles(matr5, probs=probs)
print(q)

我想提取这数千个文件中每个文件的第五列(temp)并进行分位数等计算。

我首先尝试读取“ress”中的所有子文件

后者没有给出错误,但我的主要问题是“data.filesf”不是矩阵而是列表,实际上第五列不是我所期望的。然后是以下内容:

matr5 <- do.call(rbind, subs5)

也没有给出所需的值/结果。

将列放入巨大矩阵的最佳方法是什么?


尝试 lapply(data.file,[,5) 希望这会有所帮助

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