我有一个程序，通常在 Linux 的 conda 环境中运行，因为我用它来管理我的库，指令如下：
source activate my_environment
python hello_world.py
我怎样才能跑你好世界.py在与 PBS 一起工作的高级计算机中。说明解释了如何运行调整代码脚本文件，如下所示，并使用指令调用qsub.
# script.sh
#!/bin/sh
#PBS -S /bin/sh
#PBS -N job_example
#PBS -l select=24
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
mpiexec ./programa_mpi
如何使用我的 anaconda 环境通过 qsub 运行 hello_world.py？
除非它在默认环境中，否则还需要在 SGE(qsub) 脚本内“加载”conda（我认为 slurm 脚本也适用类似的事情）。例如，我已将 conda 安装到下面在 SGE 脚本中看到的目录，因此我导出路径（如果 conda 作为 HPCC 上的模块安装，则只需加载它即可）：
#!/bin/bash
#$ -q compute
#$ -l compute
#$ -cwd
#$ -N name
#$ -j yes
export PATH=$HOME/miniconda3/bin:$PATH
source activate my_environment
environment function code...
本文内容由网友自发贡献，版权归原作者所有，本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容，请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)
