各种seq ribo-seq rna-seq pipelines

2023-05-16

SPR WorkFlow Collection | sysPipe

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

各种seq ribo-seq rna-seq pipelines 的相关文章

  • RNA-seq数据分析(HISAT2+featureCounts+StringTie)

    RNA seq数据分析 简介1 生物基础1 1 中心法则1 2 RNA seq Protocol1 3 RNA seq总的路线图 2 数据分析2 1 前期准备2 1 1 创建目录 amp 安装conda2 1 2 常用文件格式简介 2 2
  • Ribo-seq的下游分析方法2---RibORF

    文献 xff1a RibORF Identifying genome wide translated open reading frames using ribosome profiling 是按照这个文献 的方法进行分析的过程 xff0c
  • RNA-seq数据上游分析流程(从原始数据开始)

    数据分析的基本思路 xff08 1 xff09 从ncbi的geo或者其它数据库中查找自己感兴趣的RNASeq数据 xff0c 至少要求给出如下信息 xff1a xff08 2 xff09 对芯片数据进行质量控制评价及处理 xff08 如果
  • RNA-seq流程学习笔记(4)-使用FastQC软件对fastq格式的数据进行质量控制

    今天开始学习使用FastQC软件对范例SRA测序文件的质量进行分析 主要参考文章 xff1a RNA seq 3 sra到fastq格式转换并进行质量控制 转录组入门 xff08 3 xff09 xff1a 了解fastq测序数据 用Fas
  • 【1】RNA-seq 测序数据之Hisat2比对-featurecount计算-EdgeR分析

    一 拿到 测序数据之后 xff0c 首先选择参考基因组及比对工具进行比对 1 Hisat比对 xff1a xff08 6个G的测序数据耗时20分钟 xff0c 比对率78 4 xff09 物种差异度大导致比对率低 build index h
  • Gitlab Pipelines一直无法通过的临时解决办法

    2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准 gt gt gt 新Gitlab系统是自己搭建的 xff0c 为了使用pages功能 xff0c 因为少于8 8版本貌似就不能使用 xff01 下一篇我会补充 xff0c 毕竟是转发的 xf
  • scrapy框架中多个spider,tiems,pipelines的使用及运行方法

    用scrapy只创建一个项目 xff0c 创建多个spider xff0c 每个spider指定items pipelines 启动爬虫时只写一个启动脚本就可以全部同时启动 本文代码已上传至github 链接在文未 一 xff0c 创建多个
  • shell等差、等比数列和数组拼接

    arithmetic progression 搜参数时 参数空间可能由一些散装的值和一个等差 比数列组成 如 tune alpha from 0 01 0 99 and 0 1 to 0 9 at an increment of 0 1 p
  • Shell中表示数字跨度的几种方式

    在Shell脚本中 如果要输出数字为0 20中3的倍数 可以使用下面三种方式来完成 方式一 i 0 i lt 20 i 3 for i 0 i lt 20 i 3 do echo i done 方式二 0 20 3 for i in 0 2
  • 仅第一次记录显示,除非强制处置

    我正在使用 vs 2017 写一个netcoreapp2 0库 并使用 UnitTest 项目对其进行测试 XUnit 和 NUnit 给出相同的结果 我注意到除非我强行处置我的Serilog记录器 只有第一行会出现在Seq 这是我的两堂课
  • R——按组将日期范围扩展为面板数据

    我的日期范围由两个变量分组 id and type 当前存储在名为的数据框中data 我的目标是扩大日期范围 以便我在日期范围内的每一天都有一行 其中包括相同的id and type 以下是重现数据框示例的片段 data lt struct
  • 如何在parallel.for中强制执行有序执行序列?

    我有一个简单的并行循环来做一些事情 然后我将结果保存到文件中 object items array with all items object resultArray new object numItems Parallel For 0 n
  • F# 中序列表达式的类型推断

    我想我不太明白 F 如何推断序列表达式中的类型 以及为什么即使我直接从 seq 指定元素的类型也无法正确识别类型 在以下 F 代码中 我们有一个基类 A 和两个派生类 B 和 C type A x member a X x type B x
  • R seq函数产生错误的结果[关闭]

    Closed 这个问题是无法重现或由拼写错误引起 help closed questions 目前不接受答案 似乎我的一台机器为 seq 函数产生了错误的结果 而另一台机器或在线 r fiddle http www r fiddle org
  • 我该如何处理“from”必须长度为1的错误?

    我尝试计算特定日期之间的天数 我有 2 列包含所有字符向量 start date lt c 2015 01 10 2015 01 11 2015 02 24 end date lt c 2015 03 10 2015 04 01 2015
  • 将 List[Tuple2[A,B]] 转换为 Tuple2[Seq[A],Seq[B]]

    卡在这里 尝试将案例类元组列表转换为序列元组并对结果进行多重分配 val items repo foo list gives me a List A B 我可以像这样完成多项任务 val a b items map 1 toSeq item
  • seq 和 list 之间的区别

    Clojure 语言中的 seq 和列表有什么区别 list 1 2 3 gt 1 2 3 seq 1 2 3 gt 1 2 3 这两种形式似乎被评估为相同的结果 首先 它们可能看起来相同 但实际上并非如此 class list 1 2 3
  • 当其长度不是所需总长度的倍数时重复向量

    我有一个 1666 行的数据框 我想添加一列 其中包含重复序列1 5与使用cut 进行交叉验证 它看起来像这样 Y x1 x2 Id1 1 15 3 6 1 0 1 1 2 2 2 0 05 3 3 3 0 45 2 8 4 1 85 3
  • 将多个 Future[Seq] 连接成一个 Future[Seq]

    如果没有 Future 这就是我将所有较小的 Seq 组合成一个大 Seq 的方式flatmap category getCategoryUrlKey id Int Seq Meta main method val appDomains S
  • seq在haskell中代表什么

    我是 Haskell 的新手 刚刚进入惰性世界编程 我读到seq函数非常特殊 因为它强制使用严格的评估 以便在某些情况下更加有效 但我就是找不到什么seq代表字面意思 也许严格评估Q 它应该提醒您 顺序 或 顺序 因为它允许程序员指定其参数

随机推荐