如果您仍然收到此消息,则需要更新您的mgcv
and gam
打包到最新版本。做了一个很大的改变gam
2018年2月套餐:找不到函数plot.gam。这意味着,GAM 由gam
包现在有“Gam”类,即使mgcv
包已加载,plot
不会选择mgcv::plot.gam
绘制它。
但是,在 R 会话中同时拥有这两个包仍然不安全。所以2016年提出的以下建议还是很值得推荐的。
建议
使用这个玩具函数来检查 R 会话是否可以运行 GAM 分析可能是个好主意。
GAM_status <- function () {
if (all(c("gam", "mgcv") %in% .packages())) print("Not OK")
else print("OK")
}
nsdf
is the 严格自由度数,一个专门用于mgcv
。正如您提到的:mgcv
是哪里plot.gam
函数来自.
问题是你有gam
and mgcv
,您的 R 会话中同时存在两个不兼容的包。你适合你的gam.mod
with gam::gam
,然后用mgcv::plot.gam
.
注意,使用通常是正确的::
在这里就会失去作用。通常当两个包有一些相互屏蔽的函数时,::
是补救措施。但对于mgcv
and gam
,这是完全不可能的。所以我的建议是,如果你使用gam
,切勿触摸mgcv
在您的 R 会话中,反之亦然。
所以,我开始一个新的 R 会话,并执行以下操作,一切都很好!
library(gam)
library(ISLR) # contains the Wage dataset used here
gam.mod <- gam(wage ~ s(year, 4) + s(age, 5) + education, data = Wage)
par(mfrow = c(2,2)); plot(gam.mod)
谢谢您的回答。我从未真正加载过mgcv
,我只是假设它是一个依赖项gam
。我开始了一个新的 R 会话,您提供的代码有效。我发现它实际上是car
导致同样问题的库。
mgcv
and gam
并不相互依赖,但由于mgcv
比gam
,许多包依赖于mgcv
, 例如,car:
car: Companion to Applied Regression
Functions and Datasets to Accompany J. Fox and S. Weisberg, An R Companion to
Applied Regression, Second Edition, Sage, 2011.
Version: 2.1-3
Depends: R (≥ 3.2.0)
Imports: MASS, mgcv, nnet, pbkrtest (≥ 0.4-4), quantreg, grDevices, utils,
stats, graphics
请注意“进口”字段,library(car)
将同时加载这些包。