ggplot 使用第二个数据源作为误差线失败

2023-12-19

这是关于获取一些自定义误差线的上一个问题的后续问题。

  1. 情节的外观正是我所需要的,所以不必担心仅对此进行评论(不过很高兴听到其他帮助附带的意见)
  2. 因为这些图是在循环中生成的,并且误差线实际上仅在满足条件时才添加,所以我不能简单地预先合并所有数据,因此假设出于本练习的目的,图数据和误差线数据来自不同的数据dfs。

我有一个ggplot,我尝试使用不同的数据框添加一些误差线。当我调用该图时,它表示无法从父图中找到 y 值,即使我只是尝试使用新数据添加误差线。我知道这一定是语法错误,但我很困惑......

首先让我们生成数据和绘图

library(ggplot2)
library(scales)

# some data
data.2015 = data.frame(score = c(-50,20,15,-40,-10,60),
                       area = c("first","second","third","first","second","third"),
                       group = c("Findings","Findings","Findings","Benchmark","Benchmark","Benchmark"))

data.2014 = data.frame(score = c(-30,40,-15),
                       area = c("first","second","third"),
                       group = c("Findings","Findings","Findings"))

# breaks and limits
breaks.major = c(-60,-40,-22.5,-10, 0,10, 22.5, 40, 60)
breaks.minor = c(-50,-30,-15,-5,0, 5, 15,30,50) 
limits =c(-70,70)

# plot 2015 data
ggplot(data.2015, aes(x = area, y = score, fill = group)) +
  geom_bar(stat = "identity", position = position_dodge(width = 0.9)) +
  coord_flip() +
  scale_y_continuous(limit = limits, oob = squish, minor_breaks = breaks.minor, 
                     breaks = breaks.major)

调用图 (c) 会产生预期的漂亮图,现在让我们设置误差线并尝试将它们添加为图“c”中的新层

# get the error bar values
alldat = merge(data.2015, data.2014, all = TRUE, by = c("area", "group"), 
               suffixes = c(".2015", ".2014"))
alldat$plotscore = with(alldat, ifelse(is.na(score.2014), NA, score.2015))
alldat$direction = with(alldat, ifelse(score.2015 < score.2014, "dec", "inc"))
alldat$direction[is.na(alldat$score.2014)] = "absent"

#add error bars to original plot
c <- c+
  geom_errorbar(data=alldat, aes(ymin = plotscore, ymax = score.2014, color = direction), 
                position = position_dodge(width = .9), lwd = 1.5, show.legend = FALSE)

当我现在打电话给 c 时,我得到

"Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'score' not found"

为什么它会查找 data.2015$score 当我只想它覆盖geom_errorbar使用第二个 alldat 数据框?

编辑* 我尝试使用 alldata$plotscore 和 alldat$score.2014 指定误差线的 ymin/ymax 值(我确信这是不好的做法),它会绘制,但条形图位于错误的位置/输出与图的顺序(例如交换,在基准条上,等等)


根据我的经验,这个关于找不到某个变量的错误告诉我,R 在 data.frame 中查找变量,但它不在那里。有时解决方案就像修复拼写错误一样简单,但就您而言score变量不在您用来制作误差线的数据集中。

names(alldat)
[1] "area"       "group"      "score.2015" "score.2014" "plotscore"  "direction"

The y变量是一种必要的审美geom_errorbar。因为你设置了一个y全局变量ggplot,其他几何体继承全局y除非您专门将其映射到不同的变量。在当前数据集中,您需要地图y到 2015 年分数变量。

geom_errorbar(data=alldat, aes(y = score.2015, ymin = plotscore, 
                               ymax = score.2014, color = direction), 
              position = position_dodge(width = .9), lwd = 1.5, show.legend = FALSE)

在您的评论中,您表示您还必须添加fill to geom_errobar,以及,但当我运行代码时我没有发现有必要(你可以在上面看到group是您给出的示例中第二个数据集中的变量)。

另一种选择是确保 2015 分数变量仍被命名score合并后。这可以通过更改来完成suffixes论证在merge. Then score将位于第二个数据集中,您不必设置y变量在geom_errorbar.

alldat2 = merge(data.2015, data.2014, all = TRUE, by = c("area", "group"), 
            suffixes = c("", ".2014"))
...
names(alldat2)
[1] "area"       "group"      "score"      "score.2014" "plotscore"  "direction" 
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