在 R 中创建空间数据

2024-01-20

我有一个 100 x 200 米区域内物种及其大致位置的数据集。数据框的位置部分不是我认为可用的格式。在这个 100 x 200 米的矩形中,有 200 个 10 x 10 米的正方形,分别命名为 A 到 CV。每个 10 x 10 的正方形内有四个 5 x 5 米的正方形,分别命名为 1、2、3 和 4(1 位于 2 的南边,3 的西边。4 位于 2 的东边,3 的北边)。我想让 R 知道 A 是角点位于 (0 ,0)、(10,0)、(0,0) 和 (0,10) 的正方形,B 位于 A 的北边并且有角 ( 0,10)、(0,20)、(10,10) 和 (10,20),K 位于 A 的东边,角点位于 (10,0)、(10,10)、(20, 0) 和 (20,10),对于所有 10 x 10 米的正方形,依此类推。此外,我想让 R 知道每个 5 x 5 米的正方形在 100 x 200 米图中的位置。

所以,我的数据框看起来像这样

10x10    5x5     Tree    Diameter
A    1     tree1    4
B    1     tree2    4
C    4     tree3    6
D    3     tree4    2
E    3     tree5    3
F    2     tree6    7
G    1     tree7    12
H    2     tree8    1
I    2     tree9    2
J    3     tree10   8
K    4     tree11   3
L    1     tree12   7
M    2     tree13   5

最终,我希望能够绘制 100 x 200 米的区域,并让每个 10 x 10 米的正方形显示树木数量、物种数量或总生物量 将我拥有的数据转换为 R 可用于绘图和分析的空间数据的最佳方法是什么?


这是一个开始。

## set up a vector of all 10x10 position tags
tags10 <- c(LETTERS,
            paste0("A",LETTERS),
            paste0("B",LETTERS),
            paste0("C",LETTERS[1:22]))

转换函数(例如){"J",3}到相应子正方形的中心。

convpos <- function(pos10,pos5) {
    ## convert letters to major (x,y) positions
    p1 <- as.numeric(factor(pos10,levels=tags10))  ## or use match()
    p1.x <- ((p1-1) %% 10) *10+5    ## %% is modulo operator
    p1.y <- ((p1-1) %/% 10)*10+5    ## %/% is integer division
    ## sort out sub-positions
    p2.x <- ifelse(pos5 <=2,2.5,7.5)   ## {1,2} vs {3,4} values
    p2.y <- ifelse(pos5 %%2 ==1 ,2.5,7.5)  ## odd {1,3} vs even {2,4} values
    c(p1.x+p2.x,p1.y+p2.y)
}

usage:

convpos("J",2)
convpos(mydata$tenbytenpos,mydata$fivebyfivepos)

重要笔记:

  • 这是一个概念证明,我几乎可以保证 x 和 y 坐标的对应关系不太正确。但是您应该能够逐行追踪并查看它在做什么......
  • 它应该在向量上正常工作(参见上面的第二个使用示例):我从switch to ifelse是因为
  • 您的列名称(10x10)很可能会陷入类似的情况X10.10将数据读入 R 时:参见?data.frame and ?check.names
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