使用 fread 读取分隔符长于一个字符的文本文件

2024-02-15

有没有办法获取data.tablefread读取带有分隔符的文本文件,例如"|||"?

我有一个文本文件(2GB),其中的行看起来像

aaa|||bbb|||random characters !$^!$£"!$ contain single |. |||other cols

如果无法使用fread,还有什么推荐吗?我会让他们进入data.table到底。


命令read_delim从包装中readr支持具有多个字符的分隔符。

我运行了一些基准测试(160 万行、30 列、350 mb txt 文件)。

我发现它比使用的解决方案快大约 40%strsplit通过以下方式:

do.call(rbind,strsplit(readLines('test.txt'),'~~~',fixed=T))

如果你安装gawk对于 Windows 并在 Windows 中设置适当的系统路径,您还可以执行以下操作:

fread("sed 's/|||/,/g' yourfile", sep = ',')

正如 eddi 在评论中所建议的那样。这比之前慢了大约 20%read_delim解决方案,因为它必须通过调用写入临时文件sed但比基本 R 解决方案更快。

最快的解决方案是将 fread 与sep = '|'并自行删除重复的列。如果您先验地知道它们在哪里,那么这种方法效果最好,否则可以计算出来(大概需要一些不小的时间成本)。

我无法得到fread and tstrsplit完成我的数据集,但你可能会有更好的运气。

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